277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1799 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  100 
 
 		 298 aa  597  1e-169  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  56.9 
 
 		 309 aa  340  1e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  35.22 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 329 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  36.23 
 
 		 320 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  33.75 
 
 		 326 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  27.62 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  27.62 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.42 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1900  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.77 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  30.79 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.07 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1433  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.45 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0971138  hitchhiker  0.00877932 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  28.62 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.15 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  29.53 
 
 		 324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0244  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  27.06 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0626622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  32.14 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.59 
 
 		 310 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0429  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.48 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.702533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  28.3 
 
 		 325 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.03 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  32.28 
 
 		 326 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  28.92 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.61 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  34.68 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  27.1 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  29.24 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  30 
 
 		 319 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  31.3 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  30.96 
 
 		 328 aa  105  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  26.65 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  29.97 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  30.92 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  29.73 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  31.01 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.48 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0300  ornithine cyclodeaminase  32.07 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.62 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  24.69 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1192  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.54 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  31.43 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  25.78 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  35.56 
 
 		 318 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 333 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  26.25 
 
 		 326 aa  99.4  7e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  32.22 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  28.38 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  29.55 
 
 		 330 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  28.48 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  28.81 
 
 		 320 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.86 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34775  predicted protein  28.16 
 
 		 346 aa  95.9  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.23 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  28.03 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  26.6 
 
 		 315 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.27 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4320  ornithine cyclodeaminase  35.57 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  27.76 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  28.57 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1715  ornithine cyclodeaminase  32.13 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  30.43 
 
 		 321 aa  92.4  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  26.6 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  26.56 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3527  ornithine cyclodeaminase  28.34 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  26.56 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  25.23 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.49 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 320 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  27.24 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2670  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  30.07 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  30.85 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  29.57 
 
 		 333 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0854  ornithine cyclodeaminase  33.16 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1509  ornithine cyclodeaminase  30.51 
 
 		 313 aa  86.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591483  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  29.71 
 
 		 314 aa  85.9  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6879  ornithine cyclodeaminase  32.92 
 
 		 311 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0318034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  29.15 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  28.7 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  31.65 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1706  ornithine cyclodeaminase  29.45 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0220079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3121  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135549 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.84 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  30.24 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2513  ornithine cyclodeaminase  32.65 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  29.89 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.33 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2024  ornithine cyclodeaminase  30.68 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.753366  normal  0.263377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  26.74 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>