More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0171 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0171  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0438666  normal  0.232038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1140  undecaprenyl diphosphate synthase  65.61 
 
 		 262 aa  358  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0589176  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0762  undecaprenyl diphosphate synthase  46.61 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.571626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0417  undecaprenyl diphosphate synthase  41.34 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1173  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2214  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.54 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0656  undecaprenyl diphosphate synthase  39.2 
 
 		 264 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1244  undecaprenyl diphosphate synthase  38.74 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0233  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.27 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.312975  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1416  undecaprenyl diphosphate synthase  38.58 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1385  undecaprenyl pyrophosphate synthase  42.17 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000419097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1084  undecaprenyl diphosphate synthase  39.68 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1136  undecaprenyl diphosphate synthase  39.04 
 
 		 263 aa  184  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2740  undecaprenyl diphosphate synthase  38.74 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.18159  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1328  undecaprenyl diphosphate synthase  38.46 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.190742  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1881  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  41.86 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0590  undecaprenyl diphosphate synthase  40.08 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.703731  normal  0.0783968 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1887  undecaprenyl diphosphate synthase  38.49 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.972536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0946  undecaprenyl diphosphate synthase  39.45 
 
 		 253 aa  181  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0446  undecaprenyl diphosphate synthase  37.07 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0755985  normal  0.0112382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0020  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.15 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07300  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.1 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  0.637339 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3075  undecaprenyl diphosphate synthase  41.09 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3093  undecaprenyl diphosphate synthase  37.94 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.584207 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0589  undecaprenyl diphosphate synthase  36.8 
 
 		 264 aa  178  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00221841  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4413  undecaprenyl diphosphate synthase  38.34 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05130  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.9 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00991473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08270  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.9 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0760869 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  36.97 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0732  undecaprenyl diphosphate synthase  38.98 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.522111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1431  undecaprenyl pyrophosphate synthase  41.74 
 
 		 233 aa  175  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1657  undecaprenyl diphosphate synthase  37.74 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8524  Z-farnesyl diphosphate synthase  38.82 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.920641 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  34.34 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.195371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23040  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.7 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2629  undecaprenyl diphosphate synthase  37.89 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.116931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1056  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.29 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1501  undecaprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 		 239 aa  171  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1075  undecaprenyl diphosphate synthase  37.31 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.77286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4662  undecaprenyl diphosphate synthase  37.26 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0199052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2055  undecaprenyl diphosphate synthase  37.26 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0456  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1106  undecaprenyl diphosphate synthase  39.13 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.075422  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  37.4 
 
 		 249 aa  169  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.02 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0950  undecaprenyl diphosphate synthase  38.58 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0733  undecaprenyl diphosphate synthase  35.8 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  39.92 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3135  undecaprenyl diphosphate synthase  36.6 
 
 		 281 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.87234  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  38.56 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2063  undecaprenyl diphosphate synthase  36.93 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00929872  normal  0.185257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0809  undecaprenyl diphosphate synthase  37.01 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.621731  hitchhiker  0.000251042 
 
 
-
 
NC_002620  TC0735  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  40.17 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  39.22 
 
 		 240 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  38.53 
 
 		 234 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1279  undecaprenyl diphosphate synthase  38.77 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0101  undecaprenyl diphosphate synthase  35.52 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1319  undecaprenyl diphosphate synthase  37.5 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.000351697  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.14 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.14 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.14 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.14 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.14 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.14 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0863  undecaprenyl diphosphate synthase  36.61 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.658332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.19 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4368  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.19 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.15983  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.14 
 
 		 258 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0935  undecaprenyl diphosphate synthase  39.74 
 
 		 238 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1224  undecaprenyl diphosphate synthase  35.27 
 
 		 325 aa  159  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4212  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.8 
 
 		 263 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  39.83 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  34.92 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0709  undecaprenyl diphosphate synthase  37.8 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0105503  unclonable  0.000000024348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.33 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31580  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  34.5 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0355  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 236 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.580646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1417  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.1 
 
 		 267 aa  158  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0645618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0785  undecaprenyl diphosphate synthase  35.25 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00339429  normal  0.0988544 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07700  undecaprenyl diphosphate synthase  37.02 
 
 		 240 aa  158  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.259122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  38.43 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1548  undecaprenyl diphosphate synthase  33.86 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0527  undecaprenyl diphosphate synthase  35.04 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0714  undecaprenyl diphosphate synthase  36.86 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11104  short-chain (C15) Z-isoprenyl diphosphate synthase  35.91 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.89386e-91  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1157  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  37.5 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  35.68 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1281  undecaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000016343  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0041  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  36.14 
 
 		 283 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2829  undecaprenyl diphosphate synthase  34.14 
 
 		 309 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.258717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1433  Undecaprenyl pyrophosphate synthetase  35.17 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal  0.0410509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  36 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  37.23 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  35.18 
 
 		 260 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  38.2 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>