More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2121 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2121  inner-membrane translocator  100 
 
 		 306 aa  578  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.459721 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5128  inner-membrane translocator  70.76 
 
 		 305 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0570101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1991  inner-membrane translocator  65.25 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3173  inner-membrane translocator  71.1 
 
 		 306 aa  381  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0071568  normal  0.950113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4487  inner-membrane translocator  64.26 
 
 		 306 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3829  inner-membrane translocator  64.09 
 
 		 306 aa  335  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0987  inner-membrane translocator  60 
 
 		 305 aa  322  7e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3999  inner-membrane translocator  56.95 
 
 		 308 aa  320  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4044  inner-membrane translocator  68.65 
 
 		 304 aa  318  7e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0793  inner-membrane translocator  61.3 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.901447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4210  inner-membrane translocator  58.56 
 
 		 304 aa  311  5.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0596533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2459  inner-membrane translocator  60.33 
 
 		 308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5096  inner-membrane translocator  60.47 
 
 		 303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.681438  normal  0.989251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4609  inner-membrane translocator  60.81 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1211  inner-membrane translocator  58.61 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0635  inner-membrane translocator  57.05 
 
 		 306 aa  297  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0365  inner-membrane translocator  58.28 
 
 		 306 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3269  inner-membrane translocator  56.95 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4400  inner-membrane translocator  56 
 
 		 304 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3642  inner-membrane translocator  57.28 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0861  inner-membrane translocator  59.93 
 
 		 305 aa  278  7e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.220727  normal  0.159133 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2236  inner-membrane translocator  58.03 
 
 		 306 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.428427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0733  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  63.46 
 
 		 305 aa  266  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0176  inner-membrane translocator  53.8 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1906  inner-membrane translocator  46.53 
 
 		 287 aa  254  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.768984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2986  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 287 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0359468  normal  0.478138 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4745  inner-membrane translocator  45.54 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1621  inner-membrane translocator  47.04 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1227  inner-membrane translocator  46.33 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0358415  normal  0.0652986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4370  inner-membrane translocator  44.63 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4661  inner-membrane translocator  44.11 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2951  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 315 aa  235  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4821  inner-membrane translocator  45.87 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1018  inner-membrane translocator  45.92 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0213  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 293 aa  233  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0734  inner-membrane translocator  44.48 
 
 		 286 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0078  inner-membrane translocator  46.25 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1330  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3134  inner-membrane translocator  47.87 
 
 		 288 aa  225  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3652  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0086  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 290 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2771  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0497861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3088  inner-membrane translocator  45.66 
 
 		 288 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2303  inner-membrane translocator  38.44 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0228  inner-membrane translocator  37.29 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0160417  normal  0.113525 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0499  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.29 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6212  inner-membrane translocator  39.46 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4182  inner-membrane translocator  39.39 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3211  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.64226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2893  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 652 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0852  inner-membrane translocator  39.19 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147102  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1242  inner-membrane translocator  41.61 
 
 		 628 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0431  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.14 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00135798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3734  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.07 
 
 		 290 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4265  inner-membrane translocator  39.13 
 
 		 291 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271034  decreased coverage  0.00000610723 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1174  inner-membrane translocator  40.14 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6070  inner-membrane translocator  34.55 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2713  inner-membrane translocator  35.91 
 
 		 283 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000181558  normal  0.385193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0664  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0146  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000678204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0618  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0658  inner-membrane translocator  40.13 
 
 		 286 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  0.0364428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4819  putative ABC transporter, permease protein  35.87 
 
 		 336 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3459  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1582  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5858  inner-membrane translocator  35.67 
 
 		 299 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3697  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 291 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4476  branched-chain amino acid ABC transporter permease  37.58 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.903087  normal  0.0213123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1752  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  35.38 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.495502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0183  inner-membrane translocator  40.34 
 
 		 642 aa  159  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3426  inner-membrane translocator  35.93 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6329  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2390  inner-membrane translocator  36.04 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0318684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1751  putative amino acid transmembrane protein  36.84 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.717101 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1579  inner-membrane translocator  35.58 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.687848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2900  inner-membrane translocator  37.84 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4644  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4565  inner-membrane translocator  33.96 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0477928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1587  inner-membrane translocator  35.23 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0225  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1453  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0626411  hitchhiker  0.000392486 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3168  inner-membrane translocator  34.57 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.256759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1580  inner-membrane translocator  34.56 
 
 		 288 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1494  inner-membrane translocator  36.44 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1970  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.38 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000947675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1795  branched-chain amino acid ABC transporter permease  35.38 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1769  branched-chain amino acid ABC transporter, permease  35.77 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3210  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 527 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1935  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.38 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1573  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1013  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.361525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0429  inner-membrane translocator  39.45 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.220728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1204  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6024  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1449  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268141  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1287  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 296 aa  152  7e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.02 
 
 		 294 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4168  inner-membrane translocator  35.46 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4558  inner-membrane translocator  35.49 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.815893  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6573  inner-membrane translocator  36.24 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0445304  hitchhiker  0.00930416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>