More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1921 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1921  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 335 aa  659    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.172983  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1556  ABC transporter related protein  60.93 
 
 		 341 aa  374  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0682445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1847  ABC transporter related  49.11 
 
 		 337 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2499  ABC transporter related  52.04 
 
 		 344 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  35.14 
 
 		 373 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  39.18 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  36.3 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  34.66 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  34.64 
 
 		 375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  38.78 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 367 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5375  ABC transporter related  41.02 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0766723  normal  0.734389 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  38.65 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0377  ABC transporter related  33.24 
 
 		 347 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5898  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 		 371 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  38.13 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.18 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7604  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.69 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  37.41 
 
 		 360 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  37.76 
 
 		 347 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  37.41 
 
 		 364 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3752  ABC transporter related  36.4 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840822 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  33.99 
 
 		 368 aa  157  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 		 343 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1170  ABC transporter related  40.38 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257531  normal  0.0522399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  39.59 
 
 		 366 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.39 
 
 		 364 aa  156  6e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  39.08 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4534  ABC transporter related  36.07 
 
 		 365 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0251009  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  38.1 
 
 		 356 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2349  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.36 
 
 		 365 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00542305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.64 
 
 		 341 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  39.66 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003668  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  33.13 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.55 
 
 		 362 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 355 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.73 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7192  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.27359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.61 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1646  ABC transporter related  40.59 
 
 		 352 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.324172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2057  ABC transporter related  41.89 
 
 		 361 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0767  ABC transporter component  39.02 
 
 		 357 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  39.66 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  32.18 
 
 		 369 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3664  ABC transporter related  39.05 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.530384  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  38.26 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1159  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0951538  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  35.96 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  39.66 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4138  ABC transporter related  39.05 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392842  normal  0.329133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.33 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 387 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4124  ABC transporter related  37.24 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.680035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.96 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4242  ABC transporter related  37.24 
 
 		 355 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.575223  normal  0.0385451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  34.4 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2631  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.81 
 
 		 358 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.85 
 
 		 368 aa  152  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  34.29 
 
 		 363 aa  153  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3275  ABC transporter related  37.24 
 
 		 355 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0100631  normal  0.197934 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  39.06 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  38.99 
 
 		 370 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.37 
 
 		 355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.45 
 
 		 354 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0657  ABC transporter related protein  37.35 
 
 		 353 aa  152  7e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.91 
 
 		 357 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1042  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  37.96 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.78 
 
 		 378 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  38.33 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  38.89 
 
 		 368 aa  152  8e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  39.11 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  33.14 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  35.42 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3237  ABC transporter related  36.96 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.543822  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5511  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  33.23 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  35.62 
 
 		 353 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  35.87 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  35.27 
 
 		 358 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.05 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.6 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.53 
 
 		 395 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3337  ABC transporter related  43.38 
 
 		 367 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1598  ABC transporter related  34.97 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1518  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.49 
 
 		 362 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0467578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.6 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  35.42 
 
 		 353 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1769  ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744171  normal  0.0143689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3956  ABC transporter related  37.02 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.396032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2805  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.68 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  37.93 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.11 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1308  ABC transporter related  34.69 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  39.57 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>