More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1556 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1556  ABC transporter related protein  100 
 
 
341 aa  671    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0682445  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1921  ABC transporter-like protein  60.93 
 
 
335 aa  374  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.172983  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1847  ABC transporter related  50.29 
 
 
337 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
337 aa  291  8e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2499  ABC transporter related  57.14 
 
 
344 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0088  ABC transporter related  35.97 
 
 
373 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0107  ABC transporter related  42.26 
 
 
375 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1822  ABC transporter related  35.48 
 
 
370 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0290  ABC transporter related  34.26 
 
 
367 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0291  ABC transporter related  35.21 
 
 
367 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3531  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  33.42 
 
 
370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0283  ABC transporter related  33.98 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  40.22 
 
 
370 aa  155  8e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1222  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 
363 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0395  ABC transporter related  34.93 
 
 
367 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0054  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
361 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0287  ABC transporter related  33.7 
 
 
367 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  40.4 
 
 
368 aa  153  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0280  ABC transporter related  35.01 
 
 
367 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000359187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0260  ABC transporter related  40 
 
 
632 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.373262  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0826  ABC transporter related  38.35 
 
 
357 aa  152  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3742  ABC transporter related  36.03 
 
 
367 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0684002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0279  ABC transporter related  36.55 
 
 
367 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000167644 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  43.24 
 
 
353 aa  149  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  29.55 
 
 
354 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4446  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
367 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.33 
 
 
358 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  36.73 
 
 
356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 
369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  38.36 
 
 
360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.99 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  37.59 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2272  ABC transporter related  47.27 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1216  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding subunit  35.64 
 
 
361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3104  ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 
361 aa  146  4.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0370  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.15 
 
 
371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0657  ABC transporter related protein  38.22 
 
 
353 aa  146  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  41.38 
 
 
347 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0916  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 
387 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  43.2 
 
 
355 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  44.64 
 
 
346 aa  146  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1333  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.64 
 
 
361 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.938281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1811  ABC transporter, ATP-binding protein  35.83 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2303  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  33.68 
 
 
381 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  34.69 
 
 
369 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  38.32 
 
 
369 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  43.3 
 
 
342 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  37.55 
 
 
356 aa  145  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  42.79 
 
 
352 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0210  ABC transporter-related protein  31.69 
 
 
363 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4395  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 
369 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  hitchhiker  0.0000262843 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1610  ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 
318 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  31.3 
 
 
370 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
330 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1734  ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 
318 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.425726  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4878  ABC transporter related  39.73 
 
 
387 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.211799  normal  0.53709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2048  ABC transporter component  38.52 
 
 
363 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0782  ABC transporter related  39.58 
 
 
356 aa  143  4e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  42.62 
 
 
383 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1785  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
330 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  39.52 
 
 
333 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4113  ABC transporter related  32.61 
 
 
368 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.951413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2688  ABC transporter-like protein  40 
 
 
347 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.718825 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3637  ABC transporter related  34.72 
 
 
347 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671698  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1752  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
330 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  40.54 
 
 
350 aa  143  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3591  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
330 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0326  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  46.89 
 
 
352 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.099755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0214  ABC transporter-related protein  30.03 
 
 
363 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  34.44 
 
 
363 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.25 
 
 
381 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1610  ABC transporter related  34.17 
 
 
330 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.054116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4334  ABC transporter related  37.68 
 
 
369 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.197794  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  29.2 
 
 
363 aa  142  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  36.06 
 
 
366 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (putrescine)  34.53 
 
 
368 aa  142  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0967501  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0666  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.08 
 
 
367 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0172946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 
343 aa  142  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00879269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0542  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
377 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2289  ABC transporter related protein  35.49 
 
 
391 aa  142  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0682  ABC transporter-like protein  43.91 
 
 
337 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1571  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1562  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 
330 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37727  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0902  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.04 
 
 
381 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  37.5 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2858  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.76 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0664638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  40.42 
 
 
386 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0077  ABC transporter related  36.69 
 
 
347 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0473465  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.69 
 
 
368 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  40.6 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.32 
 
 
341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0530  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  37.17 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1882  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  35.69 
 
 
367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.000264611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  35.87 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.49 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0661243  hitchhiker  0.000000930284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2861  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.97 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.527786  normal  0.0270955 
 
 
-
 
NC_004310  BR1611  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.71 
 
 
381 aa  140  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  30.35 
 
 
355 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>