183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1699 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1699  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 		 248 aa  480  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.10091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0665  flagellar biosynthesis protein FliR  55.92 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.840101  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  55.1 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0700656  normal  0.100777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0691  flagellar biosynthesis protein FliR  55.1 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6516  flagellar biosynthesis protein FliR  51.22 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  41.98 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  42.04 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  47.72 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  36.07 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  35.66 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  36.63 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  38.3 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  37.45 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  35.14 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  39.04 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1036  flagellar biosynthesis protein FliR  35.24 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  33.05 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  37.19 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  36.67 
 
 		 252 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  31.4 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  32.03 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  32.34 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  27.27 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  25.44 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  32.17 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  33.03 
 
 		 259 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  25.11 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  27.39 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  31.51 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  29.87 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  32.23 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  29.09 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  24.67 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  28.63 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  29.17 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  28.21 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  27.75 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  26.7 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  27.78 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  28.96 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  28.96 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  26.87 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  24.79 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  24.09 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  26.05 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  25.32 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  29.25 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  29.44 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  21.21 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  26.15 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  26.79 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  27.23 
 
 		 258 aa  62  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3257  flagellar biosynthesis protein FliR  28.51 
 
 		 257 aa  62  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  24.66 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  24.27 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  22.49 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  22.22 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  25.11 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  25.44 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  25.69 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  28.64 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  24.19 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  27.52 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  25.55 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  24.9 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  27.4 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  28 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  28.84 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  25.46 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  26.55 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  24.66 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  27.36 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0042  type III secretion system inner membrane R protein  26.19 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  25.93 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  24.78 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  27.52 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  26.75 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  28.91 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  22.83 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  24.15 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  23.67 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03149  flagellar biosynthesis protein FliR  24.28 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  24.88 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  27.75 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  25 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  24.14 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800809 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>