More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1434 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1434  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  498  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  hitchhiker  0.00000367864 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5150  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  63.9 
 
 		 257 aa  304  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.915192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4294  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  62.6 
 
 		 258 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0555  ABC transporter related  56.45 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.917289  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2986  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.2 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39811  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0120  ABC transporter related  50.19 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3000  ABC transporter related  54.25 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0662104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0381  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livF  50.59 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246654  normal  0.90664 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0219  ABC transporter-related protein  50.58 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0053  ABC transporter related  48.29 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2548  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  55.02 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0518977  normal  0.559012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2753  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.04 
 
 		 257 aa  255  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0265  ABC transporter related  52.05 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43710  ABC transporter, LivF family  54.84 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.236667  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2222  ABC transporter related  49.42 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.801254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2274  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  49.8 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0949  ABC transporter related  49.8 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0254  ABC transporter related  49.8 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.59163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5034  ABC transporter related  52.02 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4003  ABC transporter related  49.8 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3495  ABC transporter related  56.05 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5011  ABC transporter related  50 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3439  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0295626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3877  ABC transporter related  54.98 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2720  ABC transporter related  49.17 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16627  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3803  ABC transporter related  55.2 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3360  ABC transporter related  48.99 
 
 		 271 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7161  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  52.03 
 
 		 266 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0599  ABC transporter related  47.77 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0782  ABC transporter-related protein  49.25 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1154  ABC transporter related  46.67 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1593  ABC transporter related protein  50.61 
 
 		 263 aa  234  8e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0564  ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202499  normal  0.0280468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0405  ABC transporter related  51.42 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0456  ABC transporter related  46.56 
 
 		 269 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.201413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3612  ABC transporter related  46.15 
 
 		 269 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3537  ABC transporter related  46.15 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.164335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0465  ABC transporter related  46.15 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.225794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2428  ABC transporter related  48.55 
 
 		 263 aa  225  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4180  ABC transporter related  47.98 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3838  ABC transporter related  46.94 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.173965  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0825  ABC transporter related  44.23 
 
 		 263 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0627  ABC transporter related  48.96 
 
 		 266 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_002936  DET0941  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.23 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.678413  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_812  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.64 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4066  ABC transporter related  47.3 
 
 		 272 aa  219  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.982341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2356  ABC transporter related  47.76 
 
 		 269 aa  218  7.999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0860054  normal  0.372011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1565  ABC transporter related  48.37 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.770039  normal  0.991586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  49.59 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0028  ABC transporter related  46.99 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3132  ABC transporter-related protein  41.43 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  48.76 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4576  ABC transporter related  47.79 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2931  ABC transporter related  46.09 
 
 		 237 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1555  ABC transporter related  48.15 
 
 		 279 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0541  ABC transporter related  48.55 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2606  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3910  ABC transporter related  51.03 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3797  ABC transporter related  51.03 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.166271 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000399  ABC transporter substrate-binding protein  43.43 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  53.91 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1836  ABC transporter related  43.03 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0163403  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3412  putative branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.73 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2286  ABC transporter related  47.52 
 
 		 265 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  47.3 
 
 		 233 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5719  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-bincing protein  46.96 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211944  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3505  ABC transporter component  47.77 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01989  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  51.24 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259007  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.09 
 
 		 247 aa  208  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  48.35 
 
 		 234 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3391  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0140  ABC transporter-like protein  50.21 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0377793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  48.55 
 
 		 437 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 247 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  49 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  46.89 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1865  ABC transporter related  45.12 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  45.9 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1215  ABC transporter related  50.21 
 
 		 236 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5998  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.09 
 
 		 235 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355908  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  47.33 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  48.15 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1675  ABC transporter related  50.85 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3007  ABC transporter-related protein  44.81 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0515162  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  45.56 
 
 		 237 aa  205  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  46.89 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0301  ABC transporter related  46.77 
 
 		 278 aa  204  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2304  ABC transporter related  47.77 
 
 		 279 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0386984 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  48.15 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  47.54 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  47.54 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  49.57 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  46.5 
 
 		 239 aa  202  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5393  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 294 aa  201  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.802054  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  48.56 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1874  ABC transporter related  47.93 
 
 		 233 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  0.184488 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  47.54 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  51.45 
 
 		 238 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>