More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0402 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0402  multidrug resistance efflux pump-like protein  100 
 
 		 340 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3788  multidrug resistance efflux pump-like protein  63.06 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0279  hypothetical protein  41.18 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00633  membrane fusion protein  37.89 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0283  membrane fusion protein  36.28 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.120506  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0284  hypothetical protein  40.89 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2222  secretion protein HlyD  33.73 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000915879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3996  secretion protein HlyD  29.91 
 
 		 450 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497269  hitchhiker  0.0000000255952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3960  secretion protein HlyD family protein  24.88 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06475  hypothetical protein  24.94 
 
 		 467 aa  133  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00547225  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2027  secretion protein HlyD  38.14 
 
 		 481 aa  133  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2830  secretion protein HlyD  39.89 
 
 		 454 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000458855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0709  secretion protein HlyD family protein  31.67 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000370496  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  25.52 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3658  multidrug resistance efflux pump  25.63 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  26.39 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  30.4 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0276  HlyD family secretion protein  23.44 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0227266  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  28.68 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  25.1 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  24.88 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  25.46 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  30.11 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  24.79 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.46 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 409 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0942  acriflavine resistance protein E  24.47 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  24.79 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  27.19 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5422  HlyD family secretion protein  25.24 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970488  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 426 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  21.29 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2884  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  33.61 
 
 		 479 aa  55.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0404561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  23.48 
 
 		 498 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.35 
 
 		 397 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  24.79 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  25.12 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  25.12 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  25.31 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.16 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  27.34 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  28.07 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  26.5 
 
 		 430 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2082  secretion protein HlyD  28.69 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3333  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  23.72 
 
 		 416 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1731  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  27.5 
 
 		 227 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.3 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.36 
 
 		 379 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  27.19 
 
 		 404 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0991  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.19 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2738  putative RND efflux membrane fusion protein  26.42 
 
 		 371 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254191  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  18.94 
 
 		 508 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1868  secretion protein HlyD  27.86 
 
 		 405 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  24.78 
 
 		 407 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3320  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.5 
 
 		 389 aa  53.1  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  27.96 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  26.53 
 
 		 405 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  30.71 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.23 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.23 
 
 		 370 aa  52  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 367 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.24 
 
 		 437 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  23.02 
 
 		 394 aa  52  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  29.52 
 
 		 710 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  26.58 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1783  secretion protein HlyD family protein  26.25 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  25.23 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.16 
 
 		 468 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.44 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4072  secretion protein HlyD family protein  26.98 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  28.28 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  19.59 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0056  putative type I secretion protein, HlyD family  28.7 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1094  secretion protein HlyD family protein  22.19 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3894  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.366041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2583  secretion protein HlyD family protein  25.93 
 
 		 437 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.860708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  25.64 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.23 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0954  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.52 
 
 		 380 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4439  secretion protein HlyD family protein  26.98 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.71 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  21.16 
 
 		 389 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  27.05 
 
 		 408 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4262  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.43 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  31.47 
 
 		 477 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0695  hypothetical protein  28.11 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.76 
 
 		 419 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1183  leukotoxin secretion protein-like  17.09 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0636  secretion protein HlyD family protein  21.56 
 
 		 329 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>