More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3767 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  98.49 
 
 		 397 aa  804    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 397 aa  813    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  72.22 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  37.84 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  35.55 
 
 		 395 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 		 396 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  36.43 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  36.18 
 
 		 396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  36.39 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  33.79 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  32.08 
 
 		 364 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  33.6 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  32.68 
 
 		 406 aa  164  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  32.26 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  29.23 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  29.83 
 
 		 412 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  32.3 
 
 		 404 aa  142  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  29.57 
 
 		 415 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  30.55 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.26 
 
 		 405 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  28.91 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  30.88 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  30.25 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  31.34 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.24 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  31.32 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  30.52 
 
 		 384 aa  116  5e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.14 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  28.14 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  26.87 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  26.43 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  27.04 
 
 		 381 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  26.93 
 
 		 399 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.48 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 392 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  27.49 
 
 		 407 aa  104  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  27.71 
 
 		 379 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6489  extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.225285  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  29.89 
 
 		 386 aa  102  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  29.63 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  28.05 
 
 		 373 aa  101  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6014  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6587  Extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 382 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.24 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3401  extracellular ligand-binding receptor  29.13 
 
 		 379 aa  99.8  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388266 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4434  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 		 378 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2392  extracellular ligand-binding receptor  27.6 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0457851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  27.52 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5152  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.482519  normal  0.580615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.63 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  28.69 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5249  extracellular ligand-binding receptor  28.95 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.513235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  25.76 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 416 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  26.22 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  28.03 
 
 		 413 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  25.06 
 
 		 368 aa  97.1  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3416  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2140  extracellular ligand-binding receptor  27.22 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  26.81 
 
 		 380 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.76 
 
 		 402 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  25.29 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  24.87 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4808  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0326  extracellular ligand-binding receptor  28.61 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  26.03 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  28.07 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  26.55 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64900  putative binding protein component of ABC transporter  28.26 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  25.96 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4277  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.83 
 
 		 515 aa  94.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0628932  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  28.4 
 
 		 393 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.76 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  25.26 
 
 		 385 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>