More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7977 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 1039 aa  2108    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  50.56 
 
 		 1324 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  46.95 
 
 		 495 aa  288  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0815  hypothetical protein  35.57 
 
 		 918 aa  287  7e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  45.78 
 
 		 1168 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 792 aa  279  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  39.74 
 
 		 692 aa  267  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  45.92 
 
 		 1202 aa  259  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  44.38 
 
 		 1111 aa  257  8e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  42.94 
 
 		 1096 aa  251  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  42.94 
 
 		 1096 aa  251  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 		 635 aa  231  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  38.89 
 
 		 624 aa  228  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 		 655 aa  224  6e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 851 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  43.11 
 
 		 655 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  38.08 
 
 		 500 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 500 aa  222  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 655 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  37.81 
 
 		 1163 aa  206  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 1132 aa  206  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 		 1124 aa  204  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  32.63 
 
 		 1132 aa  204  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 496 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 		 620 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  40.97 
 
 		 620 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 633 aa  189  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 717 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  51.16 
 
 		 1164 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  50.58 
 
 		 1164 aa  178  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 907 aa  172  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2956  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 780 aa  167  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.900663 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  33.9 
 
 		 728 aa  161  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 		 705 aa  161  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 728 aa  161  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 559 aa  157  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5910  putative PAS/PAC sensor protein  49.06 
 
 		 739 aa  152  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.79 
 
 		 809 aa  152  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  30.45 
 
 		 872 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.53 
 
 		 1063 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.9 
 
 		 1261 aa  148  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 713 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 840 aa  147  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.46 
 
 		 1061 aa  146  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 713 aa  144  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  33.15 
 
 		 717 aa  144  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 897 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 850 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 1645 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  30.45 
 
 		 733 aa  141  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0816  hypothetical protein  43.79 
 
 		 230 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 1001 aa  139  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  32.69 
 
 		 326 aa  138  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 499 aa  137  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 662 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 		 844 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0167  signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 336 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 1016 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  31.44 
 
 		 1041 aa  135  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 		 844 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 455 aa  134  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 601 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 582 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3344  signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 336 aa  132  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 759 aa  132  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.62 
 
 		 720 aa  131  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0507  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 336 aa  129  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 735 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1191 aa  128  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 512 aa  128  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 602 aa  127  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0975  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.1 
 
 		 508 aa  127  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.01 
 
 		 1124 aa  127  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.26 
 
 		 1185 aa  126  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 583 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 372 aa  126  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 575 aa  125  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 484 aa  124  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 465 aa  124  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 489 aa  123  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  30.62 
 
 		 583 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 551 aa  122  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 571 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 409 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 528 aa  122  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 339 aa  121  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 586 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.06 
 
 		 1407 aa  120  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 1002 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  29.03 
 
 		 1027 aa  119  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 500 aa  119  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  37.38 
 
 		 234 aa  118  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 1354 aa  118  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  30.58 
 
 		 488 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 488 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 234 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 346 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 347 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>