More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0768 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0768  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2047  response regulator receiver protein  85.04 
 
 		 127 aa  210  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000802297 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3300  response regulator receiver protein  64.23 
 
 		 127 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.420279 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4605  response regulator receiver domain-containing protein  56.91 
 
 		 149 aa  139  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2284  response regulator receiver protein  43.24 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3910  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.867729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1889  response regulator receiver domain-containing protein  40.38 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3725  CheC, inhibitor of MCP methylation  41.75 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003520  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  37.38 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2061  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0127  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  41.44 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0063  response regulator receiver:LytTr DNA-binding region  41.44 
 
 		 248 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  37.84 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.17 
 
 		 557 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2329  response regulator receiver  32.17 
 
 		 301 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.25746  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1064 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 		 811 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.79 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.61 
 
 		 244 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02240  hypothetical protein  37.14 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0279  two-component response regulator AlgR  41.96 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1771  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  45.45 
 
 		 613 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4223  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2735  response regulator receiver domain-containing protein  36.08 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.08 
 
 		 364 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0325  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 298 aa  60.5  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314809  normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6007  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  41.07 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.404994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69470  alginate biosynthesis regulatory protein AlgR  41.07 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.184834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2738  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000186206  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 229 aa  60.5  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2931  response regulator receiver protein  38.39 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2761  response regulator receiver  34.51 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.428071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3355  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.687232  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  32.46 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  37.1 
 
 		 469 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1738  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0418251 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0600  response regulator  30.36 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 878 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30870  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  34.29 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1834  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 681 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1039  response regulator  40.37 
 
 		 334 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1164 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 927 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  35.45 
 
 		 1164 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 501 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2670  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3595  response regulator receiver  33.33 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0403  chemotaxis protein CheY  33.62 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.286627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4295  putative chemotaxis response regulator CheY  32.11 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0656187  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02404  transcriptional regulator LuxR/uhpA family  33.65 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1263  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3065  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735156  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  39.45 
 
 		 254 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5488  two-component response regulator AlgR  37.5 
 
 		 248 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1587  response regulator  33.88 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.458847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2464  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 685 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3119  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3668  two-component response regulator AlgR  40.74 
 
 		 243 aa  57.4  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00827536  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0868  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 650 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3845  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  33.65 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0678  response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0473  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 719 aa  56.6  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3929  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0321819 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1201  response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0787  response regulator  33.06 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.54167  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2921  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.66 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3578  response regulator  37.6 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.628776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0207  LytTR family two component transcriptional regulator  38.74 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.91 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2985  fused histidine kinase sensor/response regulator  33.33 
 
 		 1121 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.446873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2708  sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 530 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  25.71 
 
 		 822 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.05 
 
 		 1548 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2684  response regulator receiver domain-containing protein  34.58 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0762  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.218112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7024  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228945  hitchhiker  0.00000126596 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.55 
 
 		 491 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2159  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.691441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>