97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3635 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3635  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  510  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440298 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1925  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1278  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41.46 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.711886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  38.84 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2325  Helix-turn-helix, AraC domain protein  43.15 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0165435  normal  0.523007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  25.1 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  26.8 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  23.79 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1643  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  21.3 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  26.75 
 
 		 244 aa  62  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1655  hypothetical protein  23.67 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.05 
 
 		 271 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1962  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 261 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  20.53 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  24.89 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  22.05 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  23.49 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  22.75 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  25.1 
 
 		 272 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3275  transcriptional regulator, AraC family  23.15 
 
 		 229 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.145248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 303 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  19.61 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 300 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1931  helix-turn-helix, AraC type  23.67 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  21.57 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  21.77 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3326  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 272 aa  50.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.75 
 
 		 261 aa  50.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  20.08 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.09 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  26.37 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  20.69 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4435  transcriptional regulator, AraC family  27.71 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0681561  normal  0.0120203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 277 aa  45.8  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1969  transcriptional regulator, AraC family  20.08 
 
 		 282 aa  45.8  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0909841  normal  0.074502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 306 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 306 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 310 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 276 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4867  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2830  AraC family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4467  helix-turn-helix domain-containing protein  23 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0353023 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  25.25 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  20.78 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 519 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.71 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  19.74 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2695  transcriptional regulator, AraC family  25.25 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0816587  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2980  transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  21.78 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  20.17 
 
 		 409 aa  43.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 409 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 409 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  22.69 
 
 		 409 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1584  two component AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  22.69 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  21.31 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.57 
 
 		 288 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4554  AraC family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 256 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 285 aa  42  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  35 
 
 		 278 aa  42  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 309 aa  42  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>