More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3271 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3271  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3381  transcriptional regulator, LysR family  65.41 
 
 		 296 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1350  transcriptional regulator, LysR family  61.95 
 
 		 303 aa  363  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3502  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 310 aa  295  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0949  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 		 292 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01219  putative LysR-family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  32.97 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1156  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2825  LysR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0726357  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  34.18 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1578  transcriptional regulator, LysR family  31.75 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1832  LysR family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2423  LysR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6757  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03340  transcriptional regulator  27.37 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1115  transcriptional regulator, LysR family  29.21 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4460  LysR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1024  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.849003  normal  0.711621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4144  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1471  transcriptional regulator, LysR family  23.2 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004316  transcriptional regulator LysR family  26.4 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.610995  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 323 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0310  transcriptional regulator, LysR family  36.81 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2826  LysR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123766 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4464  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0553  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0604  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1721  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1657  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0706  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4348  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.286195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0053  transcriptional regulator, LysR family  28.1 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2226  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539476  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4175  LysR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.825344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1928  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3526  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.07 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.33739  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002655  LysR-like transcriptional regulator  25.57 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2016  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0921  LysR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2309  transcriptional regulator  26.52 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2037  transcriptional regulator, LysR family  27.4 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0223119  hitchhiker  0.000202643 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0101  transcriptional regulator, LysR family  25.48 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4697  LysR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5492  LysR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0660  LysR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.641182 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4790  LysR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 328 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  25.7 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1351  LysR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.72 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0091  transcriptional regulator, LysR family  25.8 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3334  transcription regulator protein  41.67 
 
 		 298 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  26.49 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4616  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  43.12 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3322  transcriptional regulator, LysR family  27.94 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0151906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4866  transcriptional regulator, LysR family  25.41 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  43.12 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0736  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1546  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0468693  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3715  LysR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4269  LysR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0619  LysR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.415419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3810  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418833  hitchhiker  0.00695796 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  23.31 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06651  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46330  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4822  putative transcriptional regulatory protein (nitrogen assimilation control protein)  28.52 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.672498  normal  0.337818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0640  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3526  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0758  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4932  transcriptional regulator, LysR family  33.74 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3615  transcriptional regulator, LysR family  34.9 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1734  transcriptional regulator, LysR family  26.98 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1675  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1559  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1864  transcriptional regulator, LysR family  24.74 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>