More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0758 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0758  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6757  transcriptional regulator, LysR family  36.23 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1471  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0270  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01219  putative LysR-family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 302 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2825  LysR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0726357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1156  transcriptional regulator, LysR family  27.63 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  45.68 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3293  LysR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0639  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.130782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0997  LysR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  26.12 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3502  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2423  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 316 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1832  LysR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3361  LysR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000023746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0677  LysR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0949  transcriptional regulator, LysR family  42.05 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1350  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 303 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6148  transcriptional regulator, LysR family  23.59 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  23.63 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1578  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6583  LysR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422748  normal  0.335844 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2038  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2178  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 305 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0310  transcriptional regulator, LysR family  30.81 
 
 		 287 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5529  LysR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0065  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3141  transcriptional regulator LysR family  25.48 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1512  LysR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410593  normal  0.21533 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2423  LysR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2148  LysR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2983  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0899022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1544  LysR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3040  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2722  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0910097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3655  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.781642 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2185  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3573  hypothetical protein  25.71 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2975  LysR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4912  transcriptional regulator, LysR family  45.45 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3271  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0447  transcriptional regulator, LysR family  35.48 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  29.24 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5542  transcriptional regulator, LysR family  24.2 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0196792  hitchhiker  0.00000723817 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  24.67 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2272  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.565879  normal  0.046421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1247  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329564  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2779  LysR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4755  LysR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18022  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1023  LysR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3881  LysR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4319  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4118  LysR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00686854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2906  LysR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113134 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0658  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  26.67 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0079  LysR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4759  transcriptional regulator, LysR family  30.71 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3693  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4037  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0897  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3833  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2004  LysR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0456  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0935  LysR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4307  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 294 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  34.07 
 
 		 288 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1047  LysR family transcriptional regulator  32 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6361  nitrogen assimilation transcriptional regulator  34.69 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4303  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1837  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0586  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1084  LysR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000126748  hitchhiker  0.00000896339 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8569  transcriptional regulator, LysR family  28.06 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1659  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.362999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0476  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000749343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5010  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4510  LysR family transcriptional regulator  19.86 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172827  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0070  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5074  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0481  LysR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.863841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3295  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.923456  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3526  LysR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3381  transcriptional regulator, LysR family  46.27 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5073  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3569  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.898807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3476  LysR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>