More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B0476 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0476  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 279 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000749343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4759  transcriptional regulator, LysR family  97.49 
 
 		 279 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4394  LysR family transcriptional regulator  79.5 
 
 		 280 aa  447  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4787  LysR family transcriptional regulator  78.42 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4548  LysR family transcriptional regulator  78.42 
 
 		 280 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4902  LysR family transcriptional regulator  78.42 
 
 		 280 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4384  LysR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 280 aa  443  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4768  transcriptional regulator, LysR family  78.06 
 
 		 280 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4785  transcriptional regulator, LysR family  77.7 
 
 		 280 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.6594  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3322  LysR family transcriptional regulator  67.75 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  28.8 
 
 		 302 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.68 
 
 		 301 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  27.37 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 300 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  29.84 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  26.87 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1787  LysR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000671509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  27 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  28.23 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.95 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  24.11 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2233  LysR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.518923  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  27.2 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1708  LysR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1726  LysR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000302117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 300 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2807  transcriptional regulator, LysR family  29.67 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.16 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6114  transcriptional regulator, LysR family  28.33 
 
 		 311 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5225  transcriptional regulator, LysR family  27.91 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 293 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.4 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 298 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  27.89 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  23.89 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 306 aa  95.5  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  25.28 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  30.08 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 303 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.54 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  26.76 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.41 
 
 		 305 aa  94  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3319  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  28.4 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  26.1 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  28.63 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.78 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 305 aa  93.6  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  30.62 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  30.62 
 
 		 301 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>