More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH820_4768 on replicon NC_011773
Organism: Bacillus cereus AH820



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_4768  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4548  LysR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4384  LysR family transcriptional regulator  99.29 
 
 		 280 aa  565  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4902  LysR family transcriptional regulator  99.64 
 
 		 280 aa  566  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4394  LysR family transcriptional regulator  96.43 
 
 		 280 aa  552  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4785  transcriptional regulator, LysR family  93.57 
 
 		 280 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.6594  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4787  LysR family transcriptional regulator  93.93 
 
 		 280 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0476  transcriptional regulator, LysR family  78.06 
 
 		 279 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000749343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4759  transcriptional regulator, LysR family  78.42 
 
 		 279 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3322  LysR family transcriptional regulator  67.03 
 
 		 279 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 300 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 296 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  24.91 
 
 		 343 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  25.85 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 297 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 297 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  28.4 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  26.36 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 292 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  26.86 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 298 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0396  LysR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 300 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1787  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000671509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  28.34 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  25.18 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  27.57 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  26.91 
 
 		 297 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2233  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 273 aa  89  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.518923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  24.32 
 
 		 296 aa  89  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 296 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 297 aa  89  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 296 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  26.45 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 307 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.17 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.17 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  23.05 
 
 		 297 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1930  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.17 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.17 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.17 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.17 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  27.05 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.21 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 305 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  26.28 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>