More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4787 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4787  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  568  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4394  LysR family transcriptional regulator  96.07 
 
 		 280 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4548  LysR family transcriptional regulator  94.29 
 
 		 280 aa  540  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4902  LysR family transcriptional regulator  94.29 
 
 		 280 aa  540  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4785  transcriptional regulator, LysR family  95.71 
 
 		 280 aa  542  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.6594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4384  LysR family transcriptional regulator  93.93 
 
 		 280 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4768  transcriptional regulator, LysR family  93.93 
 
 		 280 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0476  transcriptional regulator, LysR family  78.42 
 
 		 279 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000749343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4759  transcriptional regulator, LysR family  78.42 
 
 		 279 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3322  LysR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 279 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  28.09 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  28.46 
 
 		 300 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  26.67 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  30.86 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 301 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 296 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.81 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2509  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.87 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  28.4 
 
 		 304 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.87 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2625  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.351429 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2417  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  28.4 
 
 		 306 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2466  putative transcriptional regulator  28.09 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.11864 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 316 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.87 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.87 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000392  transcriptional regulator of alpha-acetolactate operon AlsR  26.71 
 
 		 293 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00388737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.87 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.87 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2213  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.6 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0834  transcriptional regulator, LysR family  29.69 
 
 		 300 aa  93.6  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3441  transcriptional regulator, LysR family  27.76 
 
 		 297 aa  92.8  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 305 aa  92.4  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 313 aa  92.4  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2233  LysR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.518923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  28.05 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 293 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  27.57 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  24.9 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  28.4 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0974  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  22.96 
 
 		 296 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  24.23 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 297 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3730  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.71 
 
 		 296 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.247106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 293 aa  90.5  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.87 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2521  putative transcriptional regulator  27.72 
 
 		 292 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 307 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1787  LysR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000671509  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3012  LysR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1454  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0215589  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 305 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3058  LysR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  26.35 
 
 		 306 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3027  LysR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 296 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  0.0983391 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4167  LysR substrate-binding protein  25.91 
 
 		 295 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.51 
 
 		 305 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  26.14 
 
 		 289 aa  89  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1323  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 302 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0574194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4202  LysR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 295 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2243  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 310 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0611  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.28 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2156  LysR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>