More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3322 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3322  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4759  transcriptional regulator, LysR family  67.75 
 
 		 279 aa  374  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0476  transcriptional regulator, LysR family  67.75 
 
 		 279 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000749343 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4787  LysR family transcriptional regulator  66.91 
 
 		 280 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4548  LysR family transcriptional regulator  66.55 
 
 		 280 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4384  LysR family transcriptional regulator  66.55 
 
 		 280 aa  370  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4394  LysR family transcriptional regulator  67.75 
 
 		 280 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4902  LysR family transcriptional regulator  66.55 
 
 		 280 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4785  transcriptional regulator, LysR family  65.83 
 
 		 280 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.6594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4768  transcriptional regulator, LysR family  67.03 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  28.36 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1688  LysR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  28.25 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  27.59 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3225  transcriptional regulator, LysR family  27.14 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3366  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.326699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2392  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2584  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156706  normal  0.234942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1787  LysR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 301 aa  102  5e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000671509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0266  LysR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  27.43 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 298 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  26.04 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0383  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.715241  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 298 aa  99.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 297 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1427  LysR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  27.09 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4555  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  26.12 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4367  LysR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2390  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1684  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 299 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00688867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0127  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.09 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.985261  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3861  LysR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 294 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.378583  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0036  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.37 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3373  hypothetical protein  27.78 
 
 		 292 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0835  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 364 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.643048  normal  0.134814 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0963  LysR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 294 aa  95.5  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1012  LysR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0144903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3117  transcriptional regulator, LysR family  27.49 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0898  transcriptional regulator, LysR family  29.03 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0193  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4531  LysR family regulatory protein  29.21 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2233  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.518923  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4666  LysR family regulatory protein  29.21 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4614  LysR family regulatory protein  29.21 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.342206 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  26.5 
 
 		 301 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4523  LysR family regulatory protein  29.21 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0352  transcriptional regulator, LysR family  23.55 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256379  normal  0.0881916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4616  LysR family regulatory protein  29.21 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 316 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6544  transcriptional regulator, LysR family  27.41 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0395202 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0187  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 302 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3794  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 294 aa  92.8  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689518 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4429  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353494  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0036  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 308 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.565587  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03846  DNA-binding transcriptional dual regulator  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.782076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4025  transcriptional regulator, LysR family  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2787  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03795  hypothetical protein  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4409  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.386018  normal  0.0576457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4195  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4503  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.030834  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5423  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.748146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4448  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4055  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  24.35 
 
 		 305 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4366  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.09 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4335  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.09 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.916411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4456  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.09 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210908 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4453  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.09 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.730139  hitchhiker  0.0000741656 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4530  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.09 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  hitchhiker  0.00000332798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  27.64 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  27.64 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  27.64 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2058  transcriptional regulator, LysR family  24.75 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.90545  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 317 aa  91.3  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  27.64 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0617  transcriptional regulator, LysR family  29.08 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4775  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  25.29 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760624  hitchhiker  0.00336049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  27.64 
 
 		 306 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  27.64 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  24.56 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0138  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  23.74 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0023  LysR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 307 aa  90.5  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.189031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>