More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0736 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0736  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.637437  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1657  LysR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 306 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0706  LysR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 306 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1928  LysR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 312 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0604  LysR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 312 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2226  LysR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 306 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539476  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1721  LysR family transcriptional regulator  93.14 
 
 		 312 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2309  transcriptional regulator  92.81 
 
 		 312 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2140  LysR family transcriptional regulator  76.77 
 
 		 304 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.393768  normal  0.0508392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0944  LysR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 293 aa  316  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47270  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1086  LysR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.869199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3714  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3062  transcriptional regulator, LysR family  44.78 
 
 		 303 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3221  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 303 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.078712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3117  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.0204094 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3033  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 303 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3101  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2370  transcriptional regulator, LysR family  45.98 
 
 		 298 aa  211  9e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0480088  normal  0.369586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 312 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5416  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 313 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 317 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3852  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463671  normal  0.50732 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  40.6 
 
 		 299 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4694  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3669  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 313 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  38.51 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  33.55 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0325  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 303 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  35.67 
 
 		 290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5078  transcriptional regulator, LysR family  35.41 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0909939  hitchhiker  0.00473765 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5503  transcriptional regulator, LysR family  37.34 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 297 aa  158  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.13 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6471  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.77 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  35.12 
 
 		 289 aa  155  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 307 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 291 aa  152  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2294  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  30.59 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 322 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  31.8 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1541  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.827921  normal  0.805114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  32.01 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2773  LysR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  34.32 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  32.35 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  31.58 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  32.01 
 
 		 304 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0128  LysR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 302 aa  146  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  31.68 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 354 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>