More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6471 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6471  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 297 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2294  transcriptional regulator  66.9 
 
 		 303 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3852  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463671  normal  0.50732 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3669  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4694  LysR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 313 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2818  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0122  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0104  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1264  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1072  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.165542  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2671  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.638028  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1541  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5078  transcriptional regulator, LysR family  43.6 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0909939  hitchhiker  0.00473765 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3572  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 312 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.439946  hitchhiker  0.00313021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0406  LysR family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2440  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35380  transcriptional regulator PtxR  41.81 
 
 		 312 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0437689  normal  0.0554057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5416  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 312 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.454667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5041  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 317 aa  208  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.401985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2983  transcriptional regulator PtxR  40.8 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1086  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.869199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0235  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 454 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0324  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 320 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0622  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.815272  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2195  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 320 aa  192  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1918  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 312 aa  192  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3714  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0933  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 453 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0234  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 448 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1687  LysR family regulatory protein  37.25 
 
 		 453 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1219  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 448 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  38.33 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0643  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 309 aa  185  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 310 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0028  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  185  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.391462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  37.28 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3221  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 303 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.078712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47270  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3033  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3117  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.396466  normal  0.0204094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3062  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.25979 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3101  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  33.92 
 
 		 302 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  35.69 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  37.98 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1149  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 305 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.181713  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  36.68 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 335 aa  169  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 289 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 316 aa  168  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  35.15 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  35.62 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  33.1 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0702  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 307 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4608  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.612778 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0187  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  37.98 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  34.46 
 
 		 300 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  34.29 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4932  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  33.45 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>