80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1674 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1674  peptidase M50  100 
 
 		 703 aa  1425    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.551659 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  40.79 
 
 		 688 aa  510  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0417  peptidase M50  37.46 
 
 		 701 aa  434  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  36.76 
 
 		 709 aa  425  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0390  peptidase M50  36.57 
 
 		 707 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270715  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0472  peptidase M50  34.6 
 
 		 702 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1149  peptidase M50  35.16 
 
 		 714 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0567  peptidase M50  34.75 
 
 		 701 aa  419  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  34.8 
 
 		 709 aa  419  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  35.18 
 
 		 709 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  34.14 
 
 		 698 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0300  hypothetical protein  35.34 
 
 		 719 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0133976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0479  peptidase M50  34.04 
 
 		 701 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0372  hypothetical protein  41.91 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.707522  normal  0.611726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3074  peptidase M50  35.31 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.688769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  34.8 
 
 		 697 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5411  putative membrane Zinc metallopeptidase, M50 family  34.98 
 
 		 699 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000871616  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3741  HlyD domain-containing protein  32.62 
 
 		 720 aa  354  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1407  M50 family peptidase  24.62 
 
 		 720 aa  196  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0925  M50 family peptidase  24.74 
 
 		 715 aa  161  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.135222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0619  M50 family peptidase  25.57 
 
 		 715 aa  160  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3966  peptidase M50  23.62 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.884919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2358  peptidase, M50 family  25.63 
 
 		 715 aa  150  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.398035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2399  M50 family peptidase  26.26 
 
 		 715 aa  150  9e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3235  M50 family peptidase  25.09 
 
 		 711 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.347928 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1342  M50 family peptidase  24.66 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2176  M50 family peptidase  25.69 
 
 		 721 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.510962  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2198  peptidase M50  25.13 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0366  peptidase M50  25.15 
 
 		 736 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4341  peptidase M50  26.05 
 
 		 367 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0325098  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3220  sterol-regulatory element binding protein (SREBP) site 2 protease family protein  33.55 
 
 		 413 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.496668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1793  cyclic nucleotide-binding protein  25.72 
 
 		 1171 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2624  cyclic nucleotide-binding protein  28.09 
 
 		 1177 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2677  hypothetical protein  34.85 
 
 		 847 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2722  hypothetical protein  34.85 
 
 		 847 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0895227  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2708  hypothetical protein  34.85 
 
 		 844 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.577877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4373  hypothetical protein  35.61 
 
 		 825 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0921  hypothetical protein  32.62 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4351  cyclic nucleotide-binding protein  31.29 
 
 		 948 aa  67.4  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2911  cyclic nucleotide-binding protein  29.11 
 
 		 1124 aa  66.6  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.965385  normal  0.0176228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2293  hypothetical protein  33.33 
 
 		 838 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2919  hypothetical protein  27.92 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33960  hypothetical protein  32.79 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3579  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  59.7  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00448549  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  26.14 
 
 		 372 aa  56.2  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3142  hypothetical protein  31.2 
 
 		 761 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0154209  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  25.32 
 
 		 366 aa  55.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3233  hypothetical protein  26.06 
 
 		 812 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.34 
 
 		 351 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  22.57 
 
 		 371 aa  53.9  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0373  hypothetical protein  27.17 
 
 		 205 aa  52  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.5146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3231  sterol-regulatory element binding protein  39.66 
 
 		 235 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.329955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1596  hypothetical protein  28.21 
 
 		 497 aa  50.8  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  23.27 
 
 		 351 aa  50.8  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2879  hypothetical protein  25.32 
 
 		 355 aa  50.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0345  RND family efflux transporter MFP subunit  24.69 
 
 		 360 aa  49.7  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0426386  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  29.21 
 
 		 297 aa  49.3  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3230  sterol-regulatory element binding protein  35.48 
 
 		 171 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01700  RND family efflux system membrane fusion protein  30.72 
 
 		 328 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3620  HlyD family secretion protein  24.16 
 
 		 294 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.315743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1796  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.08 
 
 		 360 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000436323  hitchhiker  0.00000011193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2550  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 360 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000229958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0290  putative transporter  25.13 
 
 		 383 aa  46.6  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 360 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000707575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  23.08 
 
 		 360 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000267288  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0276  transporter, putative  25.13 
 
 		 383 aa  46.2  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  23.96 
 
 		 288 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13940  Zn-dependent protease  25.34 
 
 		 379 aa  45.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.909069 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2681  secretion protein HlyD  25.78 
 
 		 289 aa  45.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.879116  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1951  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1097 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00270024  hitchhiker  0.000836755 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.85 
 
 		 361 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  29.14 
 
 		 382 aa  45.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3380  secretion protein HlyD  24.07 
 
 		 294 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00820812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  27.49 
 
 		 376 aa  44.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  29.24 
 
 		 382 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1569  RND family efflux transporter MFP subunit  33.67 
 
 		 415 aa  44.3  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  27.54 
 
 		 741 aa  44.3  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2322  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 315 aa  44.3  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.140996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  26.9 
 
 		 375 aa  44.3  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  25.11 
 
 		 415 aa  43.9  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>