157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3880 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 		 169 aa  334  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  64.2 
 
 		 166 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  61.68 
 
 		 171 aa  201  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  54.12 
 
 		 171 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  51.63 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  47.65 
 
 		 170 aa  117  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.77 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  36.67 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  35.85 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.73 
 
 		 189 aa  67.4  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.12 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  31.85 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.79 
 
 		 448 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.49 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  25.32 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  28.78 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  31.29 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  32 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  25.79 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  26.71 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  31.69 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  25.68 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  24.82 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.17 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  23.57 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  24.31 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  23.61 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  23.61 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  32.67 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1623  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.06 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.093851  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  24.64 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  23.29 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 		 443 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 		 443 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 		 443 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  24.48 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  31.71 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.92 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  28.07 
 
 		 196 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  23.61 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  26.09 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2826  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.12 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22.14 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22.14 
 
 		 173 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  26.9 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0879  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  29.07 
 
 		 181 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  25.53 
 
 		 175 aa  52  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  26.17 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  30.61 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  25.5 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  25.5 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  25.36 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  24.16 
 
 		 168 aa  50.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  25.18 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  25.9 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1017  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.72 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000143879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  28.26 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  23.4 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  25.49 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  24.64 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  24.83 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0416  F0F1 ATP synthase subunit B  32.98 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.489173  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0990  ATP synthase F0, B' subunit, putative  24.24 
 
 		 138 aa  48.5  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0107943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  24.46 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  25.52 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  25.71 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  27.16 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.78 
 
 		 164 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  24.68 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  23.4 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  20.57 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  27.08 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0193  F0F1 ATP synthase subunit B  25.18 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.882585 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  23.49 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  22.22 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  24.09 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  23.49 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  23.49 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  23.49 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  24.09 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  22.92 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  24.64 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>