More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1051 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1051  peptidase M23B  100 
 
 
282 aa  569  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3564  Peptidase M23  47.53 
 
 
290 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0822552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2436  peptidase M23B  37.91 
 
 
278 aa  169  5e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  43.87 
 
 
272 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  43.23 
 
 
280 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01913  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.4 
 
 
305 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0631175  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  41.76 
 
 
300 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  41.76 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
313 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1328  hypothetical protein  33.45 
 
 
282 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3617  Peptidase M23  40.65 
 
 
322 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  35.77 
 
 
271 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3491  peptidase M23B  35.82 
 
 
280 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.172269  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  42.21 
 
 
279 aa  149  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1684  peptidase M23B  39.57 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2485  peptidase M23B  47.22 
 
 
316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.927906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15100  hypothetical protein  33.09 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.132292  hitchhiker  0.000839665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2378  peptidase M23B  32.84 
 
 
282 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1296  M24/M37 family peptidase  37.44 
 
 
276 aa  146  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.492814  decreased coverage  0.0068339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  33.96 
 
 
274 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1024  peptidase M23B  37.33 
 
 
275 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1474  peptidase M23B  33.33 
 
 
287 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00227423  normal  0.920527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2783  peptidase M23B  32.29 
 
 
286 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392125  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1066  peptidase M23B  37.33 
 
 
275 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0830638  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1342  peptidase M23B  40.65 
 
 
296 aa  143  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.339231 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  41.5 
 
 
285 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  41.5 
 
 
272 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1812  peptidase M23B  39.31 
 
 
282 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0863419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1445  peptidase, M23/M37 family  33.58 
 
 
274 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.813249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  34.31 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4779  peptidase M23B  41.28 
 
 
289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.155717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1026  M24/M37 family peptidase  36.87 
 
 
275 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2496  peptidase M23B  39.72 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0441433  normal  0.0477862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2615  M24/M37 family peptidase  34.22 
 
 
288 aa  139  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  42.13 
 
 
281 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4593  peptidase M23B  40.11 
 
 
273 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1364  Peptidase M23  41.21 
 
 
263 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000583534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3376  peptidase M23B  39.7 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4198  peptidase M23B  36.28 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.663221  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1575  peptidase M23B  33.33 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.745708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1767  peptidase M23B  35.14 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.287118  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  41.94 
 
 
232 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  41.34 
 
 
285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2265  Peptidase M23  38.02 
 
 
299 aa  132  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.617569  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0123  Peptidase M23  35.97 
 
 
336 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246102 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2524  peptidase M23B  31.95 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  36.4 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3146  peptidase M23B  41.08 
 
 
299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.964655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1560  M24/M37 family peptidase  31.16 
 
 
282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275823  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  36.07 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2288  peptidase M23B  52.89 
 
 
141 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.509215  hitchhiker  0.000223736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2646  peptidase M23B  31.58 
 
 
287 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.81 
 
 
293 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1820  Peptidase M23  31.2 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0518424  normal  0.297584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2285  peptidase M23B  33.03 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00385492  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2290  peptidase M23B  33.03 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0178936  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2531  peptidase M23B  31.2 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2214  peptidase M23B  33.03 
 
 
301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.558528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2423  peptidase M23B  33.03 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2180  M24/M37 family peptidase  32.58 
 
 
311 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3107  peptidase M23B  35.53 
 
 
303 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0630  peptidase M23B  32.51 
 
 
312 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0558086 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  27.01 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3533  Peptidase M23  34.12 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0324001  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3469  Peptidase M23  34.12 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.318022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3448  peptidase M23B  34.54 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.182559  normal  0.502099 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  29.74 
 
 
268 aa  120  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3386  peptidase M23B  33.47 
 
 
318 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  32.23 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1641  Peptidase M23  34.53 
 
 
286 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0361826  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1721  peptidase M23B  39.88 
 
 
317 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216708  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  31.32 
 
 
266 aa  115  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  37.57 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  32.87 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  31.58 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  36.21 
 
 
244 aa  113  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0940  Peptidase M23  32.89 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.252904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1170  peptidase M23B  39.56 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0169  peptidase M23B  36.7 
 
 
284 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  38.62 
 
 
283 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  46.67 
 
 
649 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  43.44 
 
 
395 aa  99.8  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  34.12 
 
 
255 aa  99.8  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.84 
 
 
425 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  41.84 
 
 
412 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  40.98 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  37.97 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  31.25 
 
 
439 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  43.18 
 
 
238 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  43.9 
 
 
524 aa  96.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  43.09 
 
 
430 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  42.42 
 
 
238 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  41.84 
 
 
425 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  42.34 
 
 
751 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.02 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  42.74 
 
 
243 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40.16 
 
 
404 aa  95.5  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  40.46 
 
 
727 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  41.41 
 
 
420 aa  94  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  43.65 
 
 
320 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>