More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0732 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0732  ABC transporter related  100 
 
 		 886 aa  1792    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.93423  normal  0.195737 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2135  multidrug resistance ABC transporter ATP-binding and permease protein  35.59 
 
 		 581 aa  347  6e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0891  hypothetical protein  31.3 
 
 		 712 aa  249  1e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00925255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  29.07 
 
 		 726 aa  247  6.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2427  ABC transporter protein  29.77 
 
 		 554 aa  245  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152948  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4146  toxin secretion ABC transporter protein  29.76 
 
 		 549 aa  245  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0163  toxin secretion ATP-binding protein  31.47 
 
 		 712 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.363946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.24 
 
 		 865 aa  242  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0159  toxin secretion ATP-binding protein  31 
 
 		 704 aa  241  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0731  ABC transporter related  29.04 
 
 		 713 aa  240  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.269341  normal  0.324121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  28.03 
 
 		 743 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1881  type I secretion system ATPase  28.27 
 
 		 737 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0513  ABC transporter-related protein  30.31 
 
 		 552 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001008  ABC transporter transmembrane region  29.82 
 
 		 704 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  26.52 
 
 		 725 aa  234  7.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.27 
 
 		 1000 aa  233  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  28.76 
 
 		 700 aa  233  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1020  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.14 
 
 		 739 aa  232  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  28.36 
 
 		 731 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1510  secretion system protein B  29.06 
 
 		 718 aa  232  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.35 
 
 		 720 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  28.44 
 
 		 892 aa  231  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1473  secretion system protein B  29.06 
 
 		 718 aa  231  4e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1291  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  30.42 
 
 		 711 aa  231  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0207  ABC transporter related  30.06 
 
 		 734 aa  231  5e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  26.99 
 
 		 728 aa  231  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  28.25 
 
 		 712 aa  231  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  26.22 
 
 		 750 aa  230  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  26.8 
 
 		 728 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  27.02 
 
 		 720 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0793  type I secretion system ATPase  29.37 
 
 		 718 aa  225  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000558662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  26.84 
 
 		 720 aa  224  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3202  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.83 
 
 		 725 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.612562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3696  type I secretion system ATPase  27.5 
 
 		 720 aa  223  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.202443 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2092  type I secretion system ATPase  29.72 
 
 		 740 aa  223  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  26.63 
 
 		 980 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0135  ABC transporter-like  29.85 
 
 		 721 aa  220  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0635  type I secretion system ATPase  26.82 
 
 		 920 aa  220  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.144577  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5973  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.22 
 
 		 731 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2547  ABC transporter related  28.35 
 
 		 740 aa  219  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3770  ABC transporter related  29.65 
 
 		 719 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  28.36 
 
 		 738 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0570  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.43 
 
 		 717 aa  218  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01405  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.36 
 
 		 694 aa  218  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.637071  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 		 1038 aa  218  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  26.29 
 
 		 999 aa  218  5e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2824  ABC transporter related  27.59 
 
 		 762 aa  217  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.868273  normal  0.331155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  27.5 
 
 		 705 aa  217  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  27.82 
 
 		 1038 aa  217  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.15 
 
 		 1003 aa  216  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0185  type I secretion system ATPase  30.71 
 
 		 718 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206215 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6373  ABC transporter related  27.87 
 
 		 731 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324139  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  27.26 
 
 		 731 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0167  toxin secretion ATP-binding protein  30.71 
 
 		 718 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00008239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0804  protein secretion ABC efflux system, permease and ATP-binding protein  29.62 
 
 		 722 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0384616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0186  ABC transporter related  30.71 
 
 		 718 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0846231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0828  ABC transporter related  29.62 
 
 		 722 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.35 
 
 		 1013 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  26.9 
 
 		 721 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.12 
 
 		 1019 aa  214  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0435  ABC transporter related  26.57 
 
 		 725 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  26.26 
 
 		 723 aa  213  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5062  type I secretion system ATPase  31.44 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.507618 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6076  type I secretion system ATPase  27.5 
 
 		 733 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  26.48 
 
 		 699 aa  213  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2242  ABC transporter related  27.58 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.960631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1098  ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 		 707 aa  212  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89235  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 1006 aa  212  3e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  28.68 
 
 		 723 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1803  ABC transporter related  28.52 
 
 		 716 aa  212  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.239145 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  28.33 
 
 		 986 aa  212  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1977  ABC transporter related  28.1 
 
 		 776 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.725291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  28.39 
 
 		 714 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  26.43 
 
 		 706 aa  211  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  27.31 
 
 		 724 aa  211  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1758  type I secretion system ATPase  28.11 
 
 		 779 aa  210  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0262668 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  27.31 
 
 		 724 aa  211  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0312  ABC transporter-related protein  25.9 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.67 
 
 		 1008 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  25.56 
 
 		 982 aa  210  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  28.23 
 
 		 753 aa  210  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  26.67 
 
 		 1008 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  26.92 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0548  ABC transporter related  28.44 
 
 		 722 aa  210  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  28.2 
 
 		 714 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0053  ABC transporter related  29.15 
 
 		 719 aa  209  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0300  ABC transporter related  28.08 
 
 		 721 aa  208  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3852  ABC export transporter, fused inner membrane and ATPase subunits  27.64 
 
 		 724 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4099  type I secretion system ATPase  25.78 
 
 		 725 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3983  ABC transporter related  25.78 
 
 		 725 aa  207  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.51 
 
 		 1016 aa  207  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0843  type I secretion system ATPase  29.08 
 
 		 722 aa  207  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3906  type I secretion system ATPase  25.78 
 
 		 725 aa  207  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2660  ABC transporter related  27.21 
 
 		 687 aa  207  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  28.06 
 
 		 738 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.71 
 
 		 1001 aa  207  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  26.83 
 
 		 971 aa  206  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4005  ABC transporter related  25.78 
 
 		 725 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40240  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  28.13 
 
 		 723 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.587032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  24.57 
 
 		 739 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>