245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0266 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  100 
 
 
710 aa  1453    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  98.31 
 
 
710 aa  1435    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  98.03 
 
 
710 aa  1431    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  88.87 
 
 
710 aa  1319    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  76.09 
 
 
717 aa  1149    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  47.13 
 
 
676 aa  530  1e-149  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  46.31 
 
 
676 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  44.95 
 
 
672 aa  528  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  46.47 
 
 
672 aa  525  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  42.88 
 
 
674 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  45.07 
 
 
676 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  43.57 
 
 
674 aa  515  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  42.84 
 
 
674 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  42.84 
 
 
674 aa  498  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  46.47 
 
 
670 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  40.31 
 
 
676 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  40.45 
 
 
668 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  36.99 
 
 
724 aa  420  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  36.6 
 
 
626 aa  340  7e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  31.22 
 
 
700 aa  324  4e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  37.81 
 
 
677 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  37.81 
 
 
677 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  33.29 
 
 
706 aa  318  2e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  33.65 
 
 
700 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  32.32 
 
 
696 aa  313  9e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.99 
 
 
700 aa  311  2e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  29.92 
 
 
689 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  32.99 
 
 
703 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  29.96 
 
 
717 aa  293  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  36.15 
 
 
607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  33.98 
 
 
693 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  31.4 
 
 
694 aa  268  2e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  31.35 
 
 
686 aa  262  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  32.26 
 
 
688 aa  260  5.0000000000000005e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  27.92 
 
 
695 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  27.73 
 
 
682 aa  226  8e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  29.84 
 
 
679 aa  226  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  35.99 
 
 
873 aa  223  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  28.2 
 
 
680 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  28.91 
 
 
882 aa  221  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  28.16 
 
 
680 aa  220  8.999999999999998e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  30.61 
 
 
686 aa  218  4e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  28.43 
 
 
761 aa  205  3e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  36.17 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  26.23 
 
 
717 aa  196  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  27.87 
 
 
755 aa  194  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  33.33 
 
 
1059 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  27.94 
 
 
551 aa  194  6e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  38.19 
 
 
1064 aa  194  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  33.25 
 
 
1412 aa  192  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  26.44 
 
 
811 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  26.93 
 
 
729 aa  185  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  29.75 
 
 
675 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.09 
 
 
717 aa  184  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  27.66 
 
 
707 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  34.47 
 
 
1342 aa  181  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  27.39 
 
 
788 aa  176  9e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  27.89 
 
 
791 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  25 
 
 
989 aa  176  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  28.59 
 
 
848 aa  176  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  26.39 
 
 
795 aa  175  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  29.77 
 
 
618 aa  174  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  26.29 
 
 
739 aa  174  5.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  25.13 
 
 
932 aa  173  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  28 
 
 
667 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  31.77 
 
 
949 aa  172  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  28.93 
 
 
847 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  25.76 
 
 
841 aa  170  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  26.2 
 
 
808 aa  169  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  29.71 
 
 
876 aa  167  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  27.19 
 
 
796 aa  163  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  26.22 
 
 
890 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  31.13 
 
 
963 aa  161  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  25.63 
 
 
859 aa  160  6e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  26.38 
 
 
724 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  32.1 
 
 
709 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  24.85 
 
 
710 aa  154  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  30.96 
 
 
915 aa  150  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  29.83 
 
 
660 aa  148  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  27.68 
 
 
556 aa  147  9e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  25.37 
 
 
487 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  25.28 
 
 
467 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  28.8 
 
 
501 aa  64.3  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  28 
 
 
512 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1047  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.83 
 
 
618 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  29.14 
 
 
512 aa  58.9  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  28.66 
 
 
621 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  26.06 
 
 
619 aa  58.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  29.14 
 
 
512 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  26.43 
 
 
506 aa  56.6  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  28.57 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  29.14 
 
 
512 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  25 
 
 
507 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.88 
 
 
618 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  24.78 
 
 
507 aa  55.8  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  27.54 
 
 
506 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.27 
 
 
620 aa  54.7  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  24.34 
 
 
513 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  25.58 
 
 
510 aa  54.3  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0130  Mg chelatase-related protein  29.07 
 
 
298 aa  53.9  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>