166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83251 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  55.96 
 
 
811 aa  906    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  54.16 
 
 
788 aa  840    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  100 
 
 
795 aa  1654    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  43.6 
 
 
717 aa  642    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  49.17 
 
 
618 aa  544  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  39.62 
 
 
688 aa  380  1e-104  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  41.6 
 
 
693 aa  379  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  39.45 
 
 
755 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  37.46 
 
 
949 aa  365  2e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  40.38 
 
 
882 aa  361  3e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  39.27 
 
 
932 aa  353  8e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  39.3 
 
 
796 aa  350  6e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  36.95 
 
 
963 aa  349  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  36.85 
 
 
700 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  41.59 
 
 
679 aa  347  4e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  37.03 
 
 
989 aa  345  2e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  37.98 
 
 
724 aa  343  9e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  37.39 
 
 
791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  37.91 
 
 
890 aa  339  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  40.12 
 
 
680 aa  339  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  39.8 
 
 
695 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  35.28 
 
 
689 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  40.28 
 
 
682 aa  337  7e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  35.2 
 
 
841 aa  336  7.999999999999999e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  37.28 
 
 
808 aa  335  2e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  38.46 
 
 
686 aa  333  6e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  40.8 
 
 
680 aa  333  6e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  41.63 
 
 
739 aa  333  9e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  36.08 
 
 
694 aa  331  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  38.55 
 
 
859 aa  330  7e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  34.1 
 
 
706 aa  328  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  35.48 
 
 
700 aa  321  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  37.9 
 
 
729 aa  320  9e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  38.18 
 
 
667 aa  317  7e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  36.95 
 
 
686 aa  316  9.999999999999999e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  35.34 
 
 
700 aa  314  3.9999999999999997e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  34.42 
 
 
717 aa  310  9e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  34.53 
 
 
848 aa  308  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  33.51 
 
 
847 aa  306  7e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  35.4 
 
 
551 aa  304  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  33.33 
 
 
696 aa  303  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  35.86 
 
 
707 aa  301  3e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  33.9 
 
 
703 aa  297  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  34.39 
 
 
876 aa  291  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  34.77 
 
 
709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  44.23 
 
 
915 aa  283  7.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  46.85 
 
 
660 aa  279  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  34.74 
 
 
556 aa  258  3e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  31.63 
 
 
761 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  29.11 
 
 
675 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  29.87 
 
 
672 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  30.92 
 
 
676 aa  214  7e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  35.87 
 
 
1059 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  34.25 
 
 
1064 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  27.69 
 
 
676 aa  206  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  27.73 
 
 
676 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  27.91 
 
 
672 aa  201  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  31.74 
 
 
674 aa  201  6e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  30.54 
 
 
487 aa  200  7e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  36.74 
 
 
1342 aa  200  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  29.96 
 
 
674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  31.25 
 
 
674 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.73 
 
 
710 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  41.03 
 
 
873 aa  196  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  28.47 
 
 
670 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  30.15 
 
 
676 aa  191  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  34.92 
 
 
458 aa  191  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  31.14 
 
 
674 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  29.49 
 
 
668 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  29.17 
 
 
717 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  33.58 
 
 
467 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  26.39 
 
 
710 aa  180  7e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  25.69 
 
 
710 aa  179  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  26.61 
 
 
717 aa  179  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  26.39 
 
 
710 aa  179  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  26.21 
 
 
710 aa  178  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  28.06 
 
 
677 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  28.06 
 
 
677 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  25.34 
 
 
724 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  31.72 
 
 
626 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  36.2 
 
 
1412 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.85 
 
 
607 aa  112  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  23.25 
 
 
337 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  21.61 
 
 
323 aa  57  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.76 
 
 
325 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  25 
 
 
326 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  25.85 
 
 
332 aa  54.3  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  26.67 
 
 
512 aa  53.5  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  26.22 
 
 
508 aa  51.6  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.94 
 
 
309 aa  51.6  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  25.35 
 
 
512 aa  50.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  29.17 
 
 
512 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  24.1 
 
 
509 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  25.61 
 
 
319 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  24.38 
 
 
319 aa  50.1  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.77 
 
 
313 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  28.06 
 
 
507 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  28.26 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1757  Mg chelatase-related protein  24.02 
 
 
518 aa  49.3  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0605  Mg chelatase, subunit ChlI  25.87 
 
 
518 aa  48.9  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>