127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0497 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  100 
 
 
693 aa  1398    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  51.91 
 
 
680 aa  641    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  52.55 
 
 
679 aa  636    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  52.34 
 
 
688 aa  694    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  52.2 
 
 
682 aa  643    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  51.56 
 
 
680 aa  632  1e-180  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  48.38 
 
 
686 aa  624  1e-177  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  48.83 
 
 
686 aa  606  9.999999999999999e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  41.88 
 
 
689 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  40.49 
 
 
700 aa  511  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  39.63 
 
 
700 aa  504  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  40.96 
 
 
700 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  39.86 
 
 
696 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  41.22 
 
 
695 aa  486  1e-136  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  41.09 
 
 
694 aa  475  1e-132  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  40.66 
 
 
717 aa  465  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  38.45 
 
 
706 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  39.68 
 
 
703 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  39.9 
 
 
882 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  39.04 
 
 
724 aa  412  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  40.69 
 
 
932 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  38.72 
 
 
739 aa  402  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  38.47 
 
 
667 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  38.54 
 
 
729 aa  402  9.999999999999999e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  40.26 
 
 
796 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  40.33 
 
 
808 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  35.89 
 
 
709 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  38.55 
 
 
890 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  35.72 
 
 
755 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  36.91 
 
 
841 aa  388  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  37.04 
 
 
989 aa  383  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  41.72 
 
 
811 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  39.61 
 
 
859 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  39.44 
 
 
791 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  43.68 
 
 
618 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  41.6 
 
 
795 aa  368  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  35.71 
 
 
963 aa  362  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  41.88 
 
 
788 aa  362  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  35.51 
 
 
848 aa  358  1.9999999999999998e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.94 
 
 
717 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  35.83 
 
 
876 aa  356  6.999999999999999e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  36.66 
 
 
847 aa  352  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  39.78 
 
 
551 aa  348  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  36.35 
 
 
707 aa  347  4e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  35.36 
 
 
949 aa  340  7e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  33.1 
 
 
717 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  35.67 
 
 
674 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  35.46 
 
 
674 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  41.65 
 
 
1342 aa  307  4.0000000000000004e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  37.88 
 
 
556 aa  307  5.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  35.77 
 
 
674 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  31.62 
 
 
672 aa  298  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  40.66 
 
 
1059 aa  296  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  30.73 
 
 
676 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  36.41 
 
 
674 aa  292  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  29.17 
 
 
676 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  47.52 
 
 
915 aa  288  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  30.58 
 
 
672 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  34.14 
 
 
710 aa  287  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  32.06 
 
 
676 aa  287  4e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  33.12 
 
 
670 aa  286  7e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  47.95 
 
 
660 aa  286  9e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  33.98 
 
 
710 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  33.98 
 
 
710 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  39.62 
 
 
1064 aa  282  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  31.58 
 
 
710 aa  280  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  30.32 
 
 
717 aa  278  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  31.55 
 
 
675 aa  276  9e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  33.83 
 
 
668 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  31.73 
 
 
676 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  41.64 
 
 
873 aa  271  2e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  35.57 
 
 
487 aa  264  4e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  45.71 
 
 
458 aa  263  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  29.82 
 
 
710 aa  246  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  33.22 
 
 
761 aa  244  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  36.02 
 
 
467 aa  244  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  32.05 
 
 
724 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  38.64 
 
 
1412 aa  201  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  30.2 
 
 
677 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  30.2 
 
 
677 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  29.72 
 
 
626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  30.83 
 
 
607 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  31.08 
 
 
314 aa  88.6  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.57 
 
 
327 aa  52  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.73 
 
 
340 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  26.01 
 
 
310 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  26.64 
 
 
356 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  24.68 
 
 
512 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  23.55 
 
 
337 aa  49.3  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  24.93 
 
 
309 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  25.83 
 
 
327 aa  48.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1092  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.67 
 
 
331 aa  48.1  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0462  MoxR family ATPase  25.91 
 
 
343 aa  47.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  26.89 
 
 
353 aa  47  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.54 
 
 
342 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5158  AAA ATPase, central region  27.6 
 
 
311 aa  47.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0242102  normal  0.260377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.24 
 
 
354 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  22 
 
 
246 aa  47.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  22.47 
 
 
506 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.7 
 
 
316 aa  47.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>