156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0316 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  50.79 
 
 
700 aa  715    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  48.27 
 
 
706 aa  650    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  49.78 
 
 
696 aa  680    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  100 
 
 
700 aa  1434    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  93.25 
 
 
1342 aa  794    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  74.36 
 
 
700 aa  1085    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  52.09 
 
 
689 aa  744    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  46 
 
 
717 aa  624  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  48.13 
 
 
703 aa  617  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  76.96 
 
 
873 aa  598  1e-169  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  43.9 
 
 
694 aa  582  1.0000000000000001e-165  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  45.6 
 
 
717 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  40.49 
 
 
693 aa  511  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  39.77 
 
 
688 aa  497  1e-139  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  80.73 
 
 
1412 aa  495  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  37.88 
 
 
686 aa  464  1e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  36.1 
 
 
686 aa  430  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  37.76 
 
 
682 aa  421  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  37.61 
 
 
680 aa  419  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  37.31 
 
 
680 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  36.98 
 
 
679 aa  415  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  35.38 
 
 
695 aa  383  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  47.92 
 
 
1059 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  35.12 
 
 
882 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  36.39 
 
 
932 aa  375  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  47.03 
 
 
1064 aa  375  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  50 
 
 
458 aa  366  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  34.98 
 
 
890 aa  362  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  34.9 
 
 
989 aa  356  6.999999999999999e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  35.33 
 
 
796 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  31.67 
 
 
755 aa  349  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  33.83 
 
 
739 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  37.12 
 
 
667 aa  345  1e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  33.64 
 
 
791 aa  345  2e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  34.98 
 
 
859 aa  340  7e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  34.85 
 
 
709 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  33.22 
 
 
724 aa  336  9e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  31.31 
 
 
710 aa  333  5e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  32.23 
 
 
808 aa  332  1e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  34.2 
 
 
729 aa  331  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  31.62 
 
 
710 aa  328  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  31.3 
 
 
710 aa  325  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  30.19 
 
 
717 aa  325  2e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  31.22 
 
 
710 aa  324  4e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  32.06 
 
 
672 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  32.03 
 
 
676 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  32.4 
 
 
949 aa  320  3.9999999999999996e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  32.32 
 
 
676 aa  318  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  33.14 
 
 
841 aa  316  9e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  36.89 
 
 
618 aa  316  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  35 
 
 
811 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  34.76 
 
 
674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  33.49 
 
 
672 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  35.34 
 
 
795 aa  308  2.0000000000000002e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  34.17 
 
 
848 aa  308  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  31.12 
 
 
676 aa  308  3e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  35.36 
 
 
717 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  36.6 
 
 
788 aa  306  6e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  32.26 
 
 
674 aa  306  7e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  34.34 
 
 
963 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  33.69 
 
 
551 aa  301  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  31.92 
 
 
876 aa  299  1e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  31.08 
 
 
670 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  34.18 
 
 
674 aa  296  8e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  31.46 
 
 
707 aa  294  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  33 
 
 
761 aa  294  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  33.33 
 
 
674 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  35.02 
 
 
847 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  31.68 
 
 
668 aa  291  3e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  31.65 
 
 
710 aa  290  7e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  31.37 
 
 
676 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  32.5 
 
 
556 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  29.82 
 
 
675 aa  273  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  30.77 
 
 
724 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  39 
 
 
915 aa  239  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  37.36 
 
 
660 aa  239  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.26 
 
 
487 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.84 
 
 
626 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  26.67 
 
 
677 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  26.67 
 
 
677 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  29.71 
 
 
467 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  38.52 
 
 
314 aa  164  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  28.17 
 
 
607 aa  161  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  27.22 
 
 
506 aa  55.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  27.47 
 
 
506 aa  54.7  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  28.67 
 
 
506 aa  54.7  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  23.51 
 
 
501 aa  53.9  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  23.51 
 
 
501 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  29.71 
 
 
528 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  29.71 
 
 
528 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  29.71 
 
 
528 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  29.71 
 
 
528 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  29.71 
 
 
528 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  29.71 
 
 
528 aa  52.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  29.71 
 
 
528 aa  52.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  29.71 
 
 
526 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  28.17 
 
 
508 aa  52  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0523  Mg chelatase, subunit ChlI  24.57 
 
 
532 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887064  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  26.26 
 
 
507 aa  51.6  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  27.47 
 
 
507 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>