92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2104 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  75.79 
 
 		 703 aa  638    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  100 
 
 		 1064 aa  2204    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  75.06 
 
 		 706 aa  657    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  68.08 
 
 		 1059 aa  1511    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  62.92 
 
 		 717 aa  567  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  56.12 
 
 		 689 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  52.68 
 
 		 700 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  52.11 
 
 		 696 aa  411  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  47.03 
 
 		 700 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  46.9 
 
 		 700 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  46.19 
 
 		 1342 aa  355  2e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  45.93 
 
 		 694 aa  345  4e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  41.11 
 
 		 688 aa  301  6e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  41.5 
 
 		 686 aa  288  4e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  39.62 
 
 		 693 aa  282  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  40.1 
 
 		 680 aa  272  2e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  39 
 
 		 686 aa  269  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  40.67 
 
 		 680 aa  268  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  41.19 
 
 		 679 aa  267  8e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  40.16 
 
 		 682 aa  266  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  37.07 
 
 		 695 aa  264  8.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 1412 aa  253  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  41.16 
 
 		 873 aa  251  7e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  38.62 
 
 		 890 aa  229  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  38.28 
 
 		 932 aa  229  3e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  36.47 
 
 		 618 aa  227  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  35.5 
 
 		 808 aa  226  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  33.65 
 
 		 796 aa  224  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  36.13 
 
 		 963 aa  221  5e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  35.22 
 
 		 841 aa  220  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  34.99 
 
 		 949 aa  218  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  35.08 
 
 		 717 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  37.26 
 
 		 717 aa  218  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  36.84 
 
 		 811 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  37.8 
 
 		 882 aa  215  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  37.35 
 
 		 788 aa  209  2e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  35.85 
 
 		 989 aa  207  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  36.9 
 
 		 729 aa  205  4e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  34.43 
 
 		 739 aa  204  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  36.78 
 
 		 848 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  38.11 
 
 		 667 aa  202  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  35.26 
 
 		 859 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  33.25 
 
 		 847 aa  197  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  39.16 
 
 		 710 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  34.25 
 
 		 795 aa  196  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  33.02 
 
 		 791 aa  196  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  38.83 
 
 		 710 aa  195  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  35.33 
 
 		 755 aa  195  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  34.76 
 
 		 707 aa  194  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  38.19 
 
 		 710 aa  194  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  37.74 
 
 		 717 aa  190  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  32.81 
 
 		 724 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  37.54 
 
 		 710 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  32.84 
 
 		 551 aa  183  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  33.14 
 
 		 709 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  42.62 
 
 		 458 aa  182  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  30.88 
 
 		 876 aa  181  8e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2478  protein splicing site  33.24 
 
 		 1080 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  35.52 
 
 		 672 aa  173  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  36.03 
 
 		 670 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.31 
 
 		 487 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  35.74 
 
 		 674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  35.66 
 
 		 676 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  35.79 
 
 		 668 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  33.51 
 
 		 915 aa  164  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  37.41 
 
 		 674 aa  164  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  34.98 
 
 		 556 aa  164  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  37.41 
 
 		 674 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  33.43 
 
 		 761 aa  164  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  34.36 
 
 		 676 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  37.06 
 
 		 674 aa  161  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  34.72 
 
 		 676 aa  161  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  34.03 
 
 		 672 aa  160  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  30.41 
 
 		 675 aa  157  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  34.57 
 
 		 724 aa  157  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.97 
 
 		 710 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  32.41 
 
 		 676 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  29.29 
 
 		 1102 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  40.87 
 
 		 660 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  30.43 
 
 		 467 aa  139  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  27.41 
 
 		 677 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  27.41 
 
 		 677 aa  112  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  24.94 
 
 		 626 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  29.41 
 
 		 314 aa  104  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  24.69 
 
 		 607 aa  98.6  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  23.14 
 
 		 1345 aa  70.1  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2433  DNA polymerase B region  22.08 
 
 		 1773 aa  68.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.897381  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1721  hypothetical protein  21.26 
 
 		 2857 aa  63.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000300122 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  28.95 
 
 		 1665 aa  59.7  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  36.47 
 
 		 1272 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0015  DNA gyrase subunit A  35.06 
 
 		 1257 aa  45.4  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336793  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0007  DNA gyrase subunit A  35.06 
 
 		 1257 aa  45.4  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>