103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2196 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  93.25 
 
 		 700 aa  795    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 1342 aa  2753    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  73.75 
 
 		 700 aa  629  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  74.09 
 
 		 873 aa  532  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  76.04 
 
 		 1412 aa  527  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  51.92 
 
 		 689 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  49.74 
 
 		 700 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  50.26 
 
 		 696 aa  380  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  48.13 
 
 		 717 aa  371  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  46.84 
 
 		 1059 aa  364  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  46.19 
 
 		 1064 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  42.72 
 
 		 694 aa  353  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  44.8 
 
 		 706 aa  351  5e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  44.5 
 
 		 717 aa  347  6e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  45.43 
 
 		 703 aa  335  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  41.65 
 
 		 693 aa  307  9.000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  39.51 
 
 		 688 aa  273  1e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  37.04 
 
 		 686 aa  263  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  39.95 
 
 		 680 aa  262  3e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  39.67 
 
 		 682 aa  260  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  39.4 
 
 		 680 aa  258  6e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  38.48 
 
 		 679 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  37.16 
 
 		 932 aa  252  3e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  36.8 
 
 		 686 aa  239  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  43.45 
 
 		 458 aa  237  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  36.48 
 
 		 890 aa  234  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  32.82 
 
 		 808 aa  225  4e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  34.1 
 
 		 796 aa  224  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  32.84 
 
 		 739 aa  216  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  36.84 
 
 		 882 aa  212  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  32.85 
 
 		 695 aa  207  8e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  35.62 
 
 		 618 aa  206  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  32.51 
 
 		 949 aa  204  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  37.37 
 
 		 667 aa  204  9e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  34.73 
 
 		 811 aa  202  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  31.24 
 
 		 709 aa  202  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  34.06 
 
 		 859 aa  200  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  35.99 
 
 		 717 aa  200  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  28.64 
 
 		 755 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  36.74 
 
 		 795 aa  196  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  35.11 
 
 		 729 aa  192  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  34.07 
 
 		 989 aa  187  9e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  33.25 
 
 		 791 aa  187  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.53 
 
 		 963 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  39.73 
 
 		 674 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  37.97 
 
 		 674 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  32.15 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  39.53 
 
 		 674 aa  186  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  39.53 
 
 		 674 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  35.09 
 
 		 710 aa  185  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  35.4 
 
 		 710 aa  185  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  34.16 
 
 		 710 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  36.18 
 
 		 676 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  30.73 
 
 		 841 aa  184  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  35.86 
 
 		 668 aa  183  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  35.22 
 
 		 672 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  33.99 
 
 		 717 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  34.47 
 
 		 710 aa  181  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  35.41 
 
 		 788 aa  179  3e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  33 
 
 		 676 aa  179  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  31.33 
 
 		 707 aa  179  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  32.49 
 
 		 710 aa  177  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  33.33 
 
 		 724 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  32.67 
 
 		 672 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  32.89 
 
 		 676 aa  174  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  33.02 
 
 		 848 aa  172  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  34.12 
 
 		 670 aa  171  6e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  31.79 
 
 		 676 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  38.11 
 
 		 314 aa  162  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  33.23 
 
 		 487 aa  162  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  33.12 
 
 		 847 aa  161  8e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  28.94 
 
 		 876 aa  160  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  31.4 
 
 		 551 aa  159  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  33.53 
 
 		 761 aa  159  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  31.63 
 
 		 556 aa  158  7e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  30.27 
 
 		 675 aa  146  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.34 
 
 		 626 aa  129  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  33.64 
 
 		 660 aa  125  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  31.42 
 
 		 915 aa  121  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  28.7 
 
 		 467 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  28.35 
 
 		 607 aa  112  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  25.75 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  25.75 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1670  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.48 
 
 		 1240 aa  77  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.346391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1608  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.96 
 
 		 1240 aa  67.8  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.863119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  24.58 
 
 		 1607 aa  67.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.66 
 
 		 1416 aa  66.6  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  25.91 
 
 		 903 aa  64.3  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  24.23 
 
 		 945 aa  63.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1025  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.58 
 
 		 1331 aa  62  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400039  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3755  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  26.74 
 
 		 1184 aa  60.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.561834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0781  RNA polymerase Rpb1 domain 5  24.18 
 
 		 907 aa  58.9  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0893602  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0442  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.1 
 
 		 955 aa  58.9  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0803  DNA recombination protein RecA precursor  25.23 
 
 		 1177 aa  57.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106303  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  22.39 
 
 		 849 aa  56.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  24.48 
 
 		 879 aa  55.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  28.07 
 
 		 1273 aa  53.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2540  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  27.84 
 
 		 1354 aa  52  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 1381 aa  51.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  27.68 
 
 		 898 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>