251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0643 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  63.79 
 
 
677 aa  798    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  100 
 
 
626 aa  1274    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  63.79 
 
 
677 aa  798    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  55.41 
 
 
607 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  39.61 
 
 
672 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  40.14 
 
 
676 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  39.61 
 
 
676 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  40 
 
 
672 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  40.34 
 
 
676 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  39 
 
 
674 aa  392  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  39.37 
 
 
674 aa  395  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  38.86 
 
 
674 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  38.49 
 
 
674 aa  388  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  38.13 
 
 
676 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  39.7 
 
 
668 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  38.02 
 
 
670 aa  372  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  39.35 
 
 
717 aa  340  4e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  36.6 
 
 
710 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  36.94 
 
 
710 aa  339  8e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  36.77 
 
 
710 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  38.97 
 
 
710 aa  335  2e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  32.21 
 
 
724 aa  259  1e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  26.84 
 
 
700 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  29.51 
 
 
689 aa  205  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  29.64 
 
 
700 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  27.77 
 
 
694 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  29.79 
 
 
717 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  29.62 
 
 
696 aa  193  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  26.03 
 
 
700 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  29.72 
 
 
693 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  28.88 
 
 
706 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  27.01 
 
 
703 aa  179  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  27.71 
 
 
686 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  28.92 
 
 
882 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  25.81 
 
 
695 aa  163  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  25.39 
 
 
796 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  28.52 
 
 
811 aa  160  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  25.32 
 
 
755 aa  160  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  33.03 
 
 
949 aa  156  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  27.12 
 
 
717 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  26.79 
 
 
808 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  26.1 
 
 
859 aa  153  8e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.93 
 
 
963 aa  153  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  28.01 
 
 
618 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  28.5 
 
 
686 aa  152  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  27.82 
 
 
680 aa  151  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  26.49 
 
 
729 aa  151  4e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  33.03 
 
 
841 aa  150  6e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  27.8 
 
 
682 aa  150  9e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  27.91 
 
 
679 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  26.86 
 
 
688 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  26.86 
 
 
788 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  29.18 
 
 
680 aa  147  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  24.22 
 
 
761 aa  147  6e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  25.4 
 
 
989 aa  146  1e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  25.38 
 
 
890 aa  145  2e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  27.54 
 
 
709 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  25.38 
 
 
791 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  31.64 
 
 
915 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  30.97 
 
 
551 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  27.37 
 
 
848 aa  141  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  30.38 
 
 
458 aa  140  7e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  24.24 
 
 
724 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  26.89 
 
 
710 aa  139  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  25.73 
 
 
707 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  30.08 
 
 
660 aa  138  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  25.44 
 
 
932 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  25.24 
 
 
876 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  25.6 
 
 
675 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  25.49 
 
 
847 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  30.24 
 
 
739 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  22.64 
 
 
717 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  26.34 
 
 
1342 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  31.72 
 
 
795 aa  126  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  25.32 
 
 
667 aa  124  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  30.66 
 
 
873 aa  111  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  24.94 
 
 
1064 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  25.74 
 
 
1059 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  24.56 
 
 
556 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  23.35 
 
 
487 aa  98.2  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  30.62 
 
 
1412 aa  94.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  28.22 
 
 
467 aa  89.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  29.29 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  25.31 
 
 
507 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  30.41 
 
 
506 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  27.31 
 
 
512 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  28.16 
 
 
498 aa  55.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  22.83 
 
 
501 aa  54.7  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  22.65 
 
 
374 aa  54.3  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  24.84 
 
 
506 aa  54.3  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  25 
 
 
507 aa  53.9  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  25.48 
 
 
506 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  24.82 
 
 
509 aa  52.8  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  27.32 
 
 
512 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  25.6 
 
 
503 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  27.91 
 
 
507 aa  52  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  25.6 
 
 
503 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  21.25 
 
 
364 aa  51.2  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  26.51 
 
 
512 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  27.59 
 
 
512 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>