100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2043 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  67.06 
 
 		 686 aa  988    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  100 
 
 		 686 aa  1392    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  48.37 
 
 		 688 aa  630  1e-179  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  48.83 
 
 		 693 aa  627  1e-178  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  48.25 
 
 		 679 aa  580  1e-164  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  47.28 
 
 		 682 aa  579  1e-164  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  47.58 
 
 		 680 aa  580  1e-164  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  48.09 
 
 		 680 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  38.58 
 
 		 689 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  39.91 
 
 		 700 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  36.1 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  39.08 
 
 		 694 aa  452  1e-125  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  38.08 
 
 		 696 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  37.27 
 
 		 695 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  36.82 
 
 		 706 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  37.97 
 
 		 717 aa  439  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  36.08 
 
 		 700 aa  425  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  37.32 
 
 		 703 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  33.9 
 
 		 755 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  37.32 
 
 		 729 aa  375  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  37.15 
 
 		 808 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  34.74 
 
 		 890 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  34.73 
 
 		 724 aa  365  2e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  34.4 
 
 		 841 aa  363  4e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  36.42 
 
 		 932 aa  362  9e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  35.06 
 
 		 796 aa  359  8e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  33.24 
 
 		 882 aa  357  5e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  33.68 
 
 		 791 aa  356  6.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  35.84 
 
 		 709 aa  356  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  33.79 
 
 		 739 aa  355  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  36.64 
 
 		 667 aa  349  9e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  32.41 
 
 		 989 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  33.91 
 
 		 859 aa  335  2e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.92 
 
 		 963 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  36.95 
 
 		 795 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  37.02 
 
 		 551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  36.17 
 
 		 811 aa  320  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  33.23 
 
 		 707 aa  319  1e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  37.21 
 
 		 788 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  35.24 
 
 		 717 aa  312  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  32.44 
 
 		 848 aa  310  4e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  34.44 
 
 		 949 aa  307  4.0000000000000004e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  31.79 
 
 		 876 aa  306  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  41.1 
 
 		 1059 aa  295  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  32.76 
 
 		 847 aa  293  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  39.23 
 
 		 1064 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  34.4 
 
 		 618 aa  281  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  33.27 
 
 		 556 aa  276  7e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  39.95 
 
 		 873 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  30.33 
 
 		 717 aa  269  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  42.46 
 
 		 915 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  46.13 
 
 		 660 aa  266  1e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  30.03 
 
 		 675 aa  262  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  32.45 
 
 		 676 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  31.21 
 
 		 674 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  31.61 
 
 		 674 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  32.94 
 
 		 676 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  36.8 
 
 		 1342 aa  258  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  34.47 
 
 		 674 aa  256  7e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  31.67 
 
 		 761 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  32.4 
 
 		 672 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  33.84 
 
 		 674 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  31.69 
 
 		 676 aa  251  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  34.79 
 
 		 487 aa  251  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  31.18 
 
 		 672 aa  247  4e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  43.27 
 
 		 458 aa  244  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  32.24 
 
 		 676 aa  239  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  27.53 
 
 		 710 aa  238  3e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  30.81 
 
 		 717 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  31.73 
 
 		 668 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  31.68 
 
 		 670 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  30.44 
 
 		 710 aa  234  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  31.58 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  31.58 
 
 		 710 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  30.93 
 
 		 710 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  33.54 
 
 		 467 aa  219  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  40.67 
 
 		 1412 aa  209  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  29.84 
 
 		 724 aa  208  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  28.5 
 
 		 626 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  25.43 
 
 		 677 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  25.43 
 
 		 677 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.27 
 
 		 607 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  25.91 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.24 
 
 		 316 aa  53.9  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.91 
 
 		 313 aa  50.4  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  23.43 
 
 		 337 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  27.78 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.99 
 
 		 318 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  24.43 
 
 		 346 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.82 
 
 		 309 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5108  ATPase  25.58 
 
 		 342 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.34364  normal  0.11344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  29.79 
 
 		 651 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4308  ATPase  25 
 
 		 345 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678403  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  24.92 
 
 		 305 aa  44.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  27.56 
 
 		 517 aa  44.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  22.22 
 
 		 312 aa  44.3  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  28.49 
 
 		 298 aa  44.3  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2080  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 461 aa  43.9  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.94 
 
 		 342 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  22.85 
 
 		 340 aa  43.9  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>