96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0237 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  100 
 
 
710 aa  1456    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  31.65 
 
 
700 aa  303  8.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  32.14 
 
 
694 aa  302  1e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  30.13 
 
 
700 aa  288  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  29.91 
 
 
689 aa  287  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  27.84 
 
 
700 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  29.77 
 
 
686 aa  258  2e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  29.64 
 
 
693 aa  258  3e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  27.78 
 
 
717 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  28.95 
 
 
696 aa  249  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  28.53 
 
 
688 aa  248  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  29.58 
 
 
680 aa  233  1e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  27.68 
 
 
686 aa  231  3e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  27.21 
 
 
706 aa  230  7e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  29.06 
 
 
703 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  29.73 
 
 
680 aa  229  1e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  29.58 
 
 
682 aa  226  9e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  30.82 
 
 
679 aa  224  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  28.68 
 
 
695 aa  220  7e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  29.11 
 
 
674 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  28.45 
 
 
672 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  29.11 
 
 
674 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  28.5 
 
 
882 aa  211  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  29.07 
 
 
674 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  28.36 
 
 
674 aa  210  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  28.52 
 
 
676 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  27.86 
 
 
672 aa  208  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  28.48 
 
 
676 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  27.69 
 
 
676 aa  207  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  29.14 
 
 
811 aa  205  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  28.21 
 
 
670 aa  204  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.46 
 
 
717 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  28.36 
 
 
795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  28.21 
 
 
788 aa  194  6e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  27.67 
 
 
755 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  26.96 
 
 
717 aa  187  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  32.45 
 
 
873 aa  187  8e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  27.36 
 
 
989 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  25.99 
 
 
667 aa  186  2.0000000000000003e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  25.56 
 
 
791 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  28.81 
 
 
668 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  26.04 
 
 
717 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  29.26 
 
 
676 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  32.49 
 
 
1342 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  28.29 
 
 
551 aa  176  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  25.85 
 
 
739 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  33.9 
 
 
458 aa  171  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  26.55 
 
 
709 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  26.53 
 
 
932 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  27.55 
 
 
618 aa  168  4e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  26.73 
 
 
841 aa  167  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  26.75 
 
 
808 aa  167  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  25 
 
 
710 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  25.88 
 
 
710 aa  167  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  27.38 
 
 
724 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  26.19 
 
 
729 aa  165  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  24.85 
 
 
710 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  25.83 
 
 
710 aa  164  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  26.67 
 
 
859 aa  163  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  26.39 
 
 
724 aa  162  3e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  25.13 
 
 
890 aa  161  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  25.24 
 
 
761 aa  160  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  25.66 
 
 
848 aa  158  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  24.91 
 
 
796 aa  154  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  26.15 
 
 
556 aa  153  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  28.97 
 
 
1064 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  30.81 
 
 
675 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.46 
 
 
626 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  26.97 
 
 
949 aa  144  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  26.39 
 
 
707 aa  140  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  24.89 
 
 
876 aa  140  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  26.01 
 
 
847 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  27.66 
 
 
1059 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  24.25 
 
 
963 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  28.37 
 
 
660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  31.85 
 
 
1412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  25.04 
 
 
915 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  25.67 
 
 
677 aa  124  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  25.67 
 
 
677 aa  124  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  25.77 
 
 
487 aa  117  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  23.23 
 
 
607 aa  96.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  28.51 
 
 
467 aa  92  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  29.91 
 
 
314 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.2 
 
 
636 aa  50.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  31.02 
 
 
506 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  30.43 
 
 
498 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  26.67 
 
 
512 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  27.68 
 
 
333 aa  46.6  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03211  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  24.49 
 
 
721 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2728  magnesium chelatase ChlI subunit  26.32 
 
 
324 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.58 
 
 
389 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03111  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  24.49 
 
 
727 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  26.92 
 
 
309 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0290  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  24.49 
 
 
725 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03121  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlD  24.49 
 
 
711 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  26.86 
 
 
510 aa  44.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>