265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3329 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  100 
 
 
498 aa  1015    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  46.43 
 
 
506 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.76 
 
 
375 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  44.72 
 
 
509 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  44.37 
 
 
509 aa  226  6e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  44.84 
 
 
382 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  44.41 
 
 
489 aa  226  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  39.53 
 
 
546 aa  223  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.29 
 
 
389 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  44.57 
 
 
464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  45.42 
 
 
547 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  46.01 
 
 
466 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  33.78 
 
 
552 aa  203  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  37.75 
 
 
553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  38.19 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  37.75 
 
 
553 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  41.83 
 
 
498 aa  199  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  41.83 
 
 
499 aa  194  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  41.83 
 
 
523 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  37.86 
 
 
543 aa  187  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  44.32 
 
 
498 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  41.06 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  42.05 
 
 
499 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  43.94 
 
 
498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  42.75 
 
 
498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  43.94 
 
 
498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  41.06 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  43.94 
 
 
498 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  41.06 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  42.75 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  42.75 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  43.94 
 
 
498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  42.75 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  42.75 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.75 
 
 
498 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  42.75 
 
 
498 aa  184  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  41.06 
 
 
498 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  42.37 
 
 
498 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  41.29 
 
 
499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  35.16 
 
 
560 aa  182  1e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  43.08 
 
 
468 aa  182  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.71 
 
 
526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.2 
 
 
528 aa  180  4.999999999999999e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.55 
 
 
436 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  42.6 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.83 
 
 
387 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.94 
 
 
407 aa  158  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  37.12 
 
 
376 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.44 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  46.63 
 
 
368 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  36.43 
 
 
390 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  46.5 
 
 
368 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  44.79 
 
 
368 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  43.95 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.22 
 
 
383 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  40.32 
 
 
379 aa  124  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  28 
 
 
339 aa  61.6  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  28.02 
 
 
309 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  28.89 
 
 
318 aa  58.5  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.96 
 
 
362 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  28.77 
 
 
333 aa  57  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.92 
 
 
336 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  30.19 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  30.19 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  30.19 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  30.19 
 
 
316 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1215  ATPase  29.55 
 
 
340 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  30.32 
 
 
318 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  28.81 
 
 
318 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.32 
 
 
318 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  30.32 
 
 
318 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  30.32 
 
 
318 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  30.32 
 
 
335 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  29.63 
 
 
318 aa  54.3  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  30.32 
 
 
318 aa  54.3  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.98 
 
 
378 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  28.49 
 
 
369 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  29.45 
 
 
318 aa  53.9  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.26 
 
 
302 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  27.41 
 
 
337 aa  53.5  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  30.32 
 
 
318 aa  53.5  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  28.22 
 
 
345 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.06 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  28.84 
 
 
332 aa  53.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2965  ATPase  28.41 
 
 
298 aa  52.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.771332  normal  0.0854936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.61 
 
 
346 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.01 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  30.57 
 
 
316 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  27.81 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  27.06 
 
 
309 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.5 
 
 
336 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  29.7 
 
 
377 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  30.13 
 
 
318 aa  52.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  31.82 
 
 
318 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.83 
 
 
360 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  27.44 
 
 
318 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1504  moxR protein  27.52 
 
 
335 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.408209  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  29.75 
 
 
319 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.61 
 
 
329 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  29.22 
 
 
326 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>