87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_71636 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  100 
 
 		 848 aa  1744    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  55.2 
 
 		 847 aa  858    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  54.05 
 
 		 876 aa  834    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  49.83 
 
 		 551 aa  543  1e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  47.11 
 
 		 707 aa  535  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  35.51 
 
 		 693 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  35.52 
 
 		 688 aa  343  7e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  33.89 
 
 		 729 aa  339  9.999999999999999e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  37.82 
 
 		 796 aa  339  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  34.78 
 
 		 890 aa  334  4e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  34.19 
 
 		 686 aa  331  4e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  36.21 
 
 		 706 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  35.26 
 
 		 667 aa  327  7e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  31.79 
 
 		 882 aa  327  7e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  35.97 
 
 		 717 aa  323  8e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  36.23 
 
 		 932 aa  322  9.999999999999999e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  32.33 
 
 		 700 aa  319  2e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  35.22 
 
 		 808 aa  318  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  30.97 
 
 		 739 aa  315  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  35.08 
 
 		 700 aa  314  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  36.55 
 
 		 680 aa  313  5.999999999999999e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  35.33 
 
 		 717 aa  314  5.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  35.3 
 
 		 703 aa  313  9e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  35.54 
 
 		 682 aa  313  9e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  33.92 
 
 		 696 aa  312  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  32.43 
 
 		 724 aa  313  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  40.39 
 
 		 859 aa  312  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  35.23 
 
 		 689 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  35.24 
 
 		 680 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  35.52 
 
 		 679 aa  309  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  34.17 
 
 		 700 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  31.7 
 
 		 694 aa  302  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  33.13 
 
 		 949 aa  301  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.87 
 
 		 963 aa  300  6e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  34.13 
 
 		 795 aa  300  8e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  30.94 
 
 		 755 aa  299  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  33.57 
 
 		 811 aa  299  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  31.6 
 
 		 695 aa  297  7e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  32.68 
 
 		 709 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  32.43 
 
 		 686 aa  293  9e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  33.33 
 
 		 788 aa  289  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  31.16 
 
 		 841 aa  287  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  31.46 
 
 		 660 aa  281  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  35.8 
 
 		 618 aa  280  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  31.28 
 
 		 791 aa  272  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  34.91 
 
 		 989 aa  260  8e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  32.62 
 
 		 556 aa  247  6e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  32.99 
 
 		 761 aa  245  3e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  30.61 
 
 		 915 aa  243  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  31.29 
 
 		 675 aa  221  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  36.78 
 
 		 1064 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  29.86 
 
 		 487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  28.55 
 
 		 676 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  28.47 
 
 		 676 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  29.32 
 
 		 672 aa  196  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  29.74 
 
 		 674 aa  193  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  27.46 
 
 		 676 aa  193  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  34.83 
 
 		 1059 aa  193  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  28.12 
 
 		 672 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.24 
 
 		 717 aa  191  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  30.5 
 
 		 710 aa  190  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  30.03 
 
 		 674 aa  188  3e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  29.98 
 
 		 674 aa  189  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  29.16 
 
 		 674 aa  187  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  27.7 
 
 		 670 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  28.55 
 
 		 717 aa  185  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  36.81 
 
 		 873 aa  183  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  28.59 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  26.8 
 
 		 668 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  28.59 
 
 		 710 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  28.43 
 
 		 710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  32.58 
 
 		 467 aa  175  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  26.03 
 
 		 676 aa  173  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  33.02 
 
 		 1342 aa  172  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  29.66 
 
 		 724 aa  154  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  30.65 
 
 		 458 aa  151  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  27.57 
 
 		 626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.87 
 
 		 710 aa  138  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  35.15 
 
 		 1412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  25.8 
 
 		 677 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  25.8 
 
 		 677 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.4 
 
 		 607 aa  111  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  35.21 
 
 		 507 aa  48.5  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  29.1 
 
 		 503 aa  47  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  27.49 
 
 		 508 aa  46.6  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_222  Holliday junction DNA helicase  31.03 
 
 		 312 aa  44.3  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  24.14 
 
 		 500 aa  44.3  0.01  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>