166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0420 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  69.85 
 
 		 674 aa  993    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  55.59 
 
 		 670 aa  765    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  70 
 
 		 674 aa  982    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  70.6 
 
 		 674 aa  993    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  56.27 
 
 		 676 aa  808    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  100 
 
 		 674 aa  1380    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  57.76 
 
 		 672 aa  816    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  53.93 
 
 		 676 aa  737    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  60.15 
 
 		 676 aa  816    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  55.67 
 
 		 676 aa  804    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  61.04 
 
 		 668 aa  829    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  56.12 
 
 		 672 aa  808    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  42.99 
 
 		 710 aa  497  1e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  42.84 
 
 		 710 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  42.84 
 
 		 710 aa  498  1e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  45.34 
 
 		 717 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  44.17 
 
 		 710 aa  483  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  42.18 
 
 		 677 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  39.37 
 
 		 626 aa  395  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  42.18 
 
 		 677 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  37.8 
 
 		 724 aa  383  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  35.67 
 
 		 693 aa  318  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  38.87 
 
 		 607 aa  317  4e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  34.76 
 
 		 700 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  31.28 
 
 		 689 aa  302  2e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.39 
 
 		 696 aa  299  9e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  32.95 
 
 		 694 aa  298  3e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  31.7 
 
 		 706 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  33.44 
 
 		 700 aa  291  2e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  33.33 
 
 		 700 aa  289  1e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  36.17 
 
 		 686 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  33.78 
 
 		 688 aa  276  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  32.79 
 
 		 717 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  30.9 
 
 		 703 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  35.99 
 
 		 679 aa  263  8.999999999999999e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  32.62 
 
 		 695 aa  260  6e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  33.97 
 
 		 682 aa  259  2e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  36.1 
 
 		 680 aa  258  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  35.65 
 
 		 680 aa  256  9e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  34.47 
 
 		 686 aa  243  9e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  32.34 
 
 		 882 aa  236  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  29.71 
 
 		 811 aa  212  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  31.32 
 
 		 788 aa  207  6e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  29.84 
 
 		 709 aa  207  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  30.51 
 
 		 791 aa  204  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  29.3 
 
 		 667 aa  203  9e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  36.31 
 
 		 873 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  28.86 
 
 		 989 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  28.34 
 
 		 675 aa  201  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  30.43 
 
 		 729 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  29.07 
 
 		 710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  28.98 
 
 		 755 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  28.47 
 
 		 932 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  26.12 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  28.93 
 
 		 739 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  28.09 
 
 		 717 aa  194  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  37.31 
 
 		 458 aa  193  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  29.96 
 
 		 795 aa  193  8e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  32.23 
 
 		 724 aa  190  7e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  29.98 
 
 		 848 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 1342 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  37.84 
 
 		 1412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  29.76 
 
 		 717 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.72 
 
 		 551 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  27.18 
 
 		 859 aa  181  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  27.69 
 
 		 890 aa  180  8e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  30.89 
 
 		 618 aa  180  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  30.67 
 
 		 707 aa  177  5e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  27.32 
 
 		 808 aa  177  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  38.08 
 
 		 915 aa  174  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  34.66 
 
 		 949 aa  173  6.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  34.44 
 
 		 847 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  27.71 
 
 		 796 aa  171  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  33.61 
 
 		 841 aa  170  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  29.62 
 
 		 556 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  35.96 
 
 		 1059 aa  169  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  35.74 
 
 		 1064 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  36.57 
 
 		 963 aa  163  8.000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  26.66 
 
 		 876 aa  161  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  33.74 
 
 		 660 aa  145  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  26.21 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  30.58 
 
 		 246 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  25.05 
 
 		 467 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  22.53 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  25.11 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  26.7 
 
 		 507 aa  54.7  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002042  Mg(2+) chelatase family protein/ComM-related protein  26.7 
 
 		 507 aa  54.3  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  29.05 
 
 		 506 aa  52.4  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3092  Mg chelatase-related protein  28.22 
 
 		 525 aa  50.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.832486  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0042  putative competence protein  25.98 
 
 		 508 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.744278  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  28.16 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  24.78 
 
 		 701 aa  50.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3782  Mg chelatase, subunit ChlI  26.76 
 
 		 499 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121114  normal  0.616165 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4231  putative ATP-dependent protease  28.5 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4110  putative ATP-dependent protease  28.5 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  28.5 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4125  putative ATP-dependent protease  28.5 
 
 		 506 aa  50.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  26.74 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4182  putative ATP-dependent protease  28 
 
 		 506 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2487  ComM-related protein  25.73 
 
 		 507 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>