120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1027 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  53.88 
 
 		 674 aa  769    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  94.38 
 
 		 676 aa  1305    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  84.38 
 
 		 672 aa  1182    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  64.25 
 
 		 676 aa  897    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  60.36 
 
 		 676 aa  840    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  100 
 
 		 676 aa  1363    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  60.98 
 
 		 668 aa  849    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  60.86 
 
 		 670 aa  871    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  53.13 
 
 		 674 aa  758    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  55.67 
 
 		 674 aa  804    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  54.33 
 
 		 674 aa  780    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  94.94 
 
 		 672 aa  1298    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  47.13 
 
 		 710 aa  531  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  46.31 
 
 		 710 aa  526  1e-148  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  45.65 
 
 		 710 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  45.65 
 
 		 710 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  44.89 
 
 		 717 aa  520  1e-146  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  44.81 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  44.81 
 
 		 677 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  39.61 
 
 		 626 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  39.39 
 
 		 724 aa  405  1e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  40.99 
 
 		 607 aa  343  7e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  32.03 
 
 		 700 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  32.16 
 
 		 706 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  32.23 
 
 		 717 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  31.37 
 
 		 689 aa  306  7e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.37 
 
 		 700 aa  302  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  30 
 
 		 696 aa  300  7e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  32.78 
 
 		 694 aa  294  3e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  33.55 
 
 		 700 aa  291  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  29.17 
 
 		 693 aa  290  4e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  31.23 
 
 		 703 aa  286  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  34.87 
 
 		 686 aa  284  5.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  30.43 
 
 		 688 aa  277  4e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  34.16 
 
 		 679 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  34.52 
 
 		 680 aa  272  1e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  33.95 
 
 		 682 aa  271  4e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  33.33 
 
 		 680 aa  267  5e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  29.23 
 
 		 695 aa  253  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  32.45 
 
 		 686 aa  246  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  29.92 
 
 		 882 aa  237  7e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  31.24 
 
 		 989 aa  225  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  28.72 
 
 		 811 aa  221  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  36.41 
 
 		 873 aa  220  8.999999999999998e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  27.69 
 
 		 755 aa  219  8.999999999999998e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  27.22 
 
 		 791 aa  207  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  29.3 
 
 		 932 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  29.38 
 
 		 788 aa  205  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.44 
 
 		 551 aa  204  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  25.11 
 
 		 761 aa  201  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  28.78 
 
 		 808 aa  201  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.52 
 
 		 710 aa  200  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  28.57 
 
 		 848 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  27.69 
 
 		 795 aa  199  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  25.72 
 
 		 667 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  27.82 
 
 		 618 aa  198  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  32.03 
 
 		 675 aa  198  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  30.94 
 
 		 729 aa  198  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  28.06 
 
 		 949 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  24.75 
 
 		 717 aa  194  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  28.26 
 
 		 717 aa  194  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  26.25 
 
 		 709 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  29.25 
 
 		 556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  30.96 
 
 		 847 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  27.49 
 
 		 890 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  28.88 
 
 		 739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  35.39 
 
 		 1412 aa  184  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  27.34 
 
 		 796 aa  183  9.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  34.2 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 1342 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.86 
 
 		 963 aa  178  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  31.73 
 
 		 876 aa  177  5e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  31.88 
 
 		 1059 aa  177  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  27.57 
 
 		 707 aa  176  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  30.19 
 
 		 841 aa  174  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  28.82 
 
 		 724 aa  174  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  26.76 
 
 		 859 aa  168  2.9999999999999998e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  32.2 
 
 		 915 aa  167  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  34.36 
 
 		 1064 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1640  MCM family DNA replication protein  35.86 
 
 		 246 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.21951  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  30.49 
 
 		 660 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  24.61 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  24.71 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  22.02 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  25.88 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  25.62 
 
 		 498 aa  48.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  20.86 
 
 		 523 aa  48.1  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  23.15 
 
 		 513 aa  47.8  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  25.36 
 
 		 512 aa  47.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  24.88 
 
 		 506 aa  47.8  0.0006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  22.64 
 
 		 504 aa  47.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4481  Magnesium chelatase  23.42 
 
 		 314 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.925614  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  21.58 
 
 		 515 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0209  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  22.37 
 
 		 701 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.910934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2254  Mg chelatase-related protein  23.4 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.049586  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2868  Mg chelatase, subunit ChlI  23.4 
 
 		 534 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  23.63 
 
 		 506 aa  45.8  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  20.58 
 
 		 500 aa  45.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  26.59 
 
 		 506 aa  45.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  25.73 
 
 		 506 aa  45.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>