More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52561 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  100 
 
 		 675 aa  1396    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  35.42 
 
 		 761 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  35.12 
 
 		 686 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  31.86 
 
 		 717 aa  320  6e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  31.37 
 
 		 689 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  32.23 
 
 		 693 aa  295  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  31.16 
 
 		 706 aa  293  8e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  29.75 
 
 		 700 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  30.92 
 
 		 700 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  32.47 
 
 		 688 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  30.38 
 
 		 694 aa  280  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  27.89 
 
 		 703 aa  279  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  32.55 
 
 		 841 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  30.92 
 
 		 882 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  33.12 
 
 		 791 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  31.91 
 
 		 949 aa  272  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  28.39 
 
 		 696 aa  270  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  29.86 
 
 		 695 aa  270  5e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  28.38 
 
 		 700 aa  269  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  32.28 
 
 		 989 aa  268  2e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  30.21 
 
 		 686 aa  268  2e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  33.07 
 
 		 682 aa  263  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  32.79 
 
 		 679 aa  261  4e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  32.54 
 
 		 680 aa  261  4e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  31.87 
 
 		 680 aa  260  6e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  30.18 
 
 		 963 aa  256  9e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  32.16 
 
 		 755 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  31.85 
 
 		 932 aa  247  4e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  32.56 
 
 		 667 aa  247  6e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  32.04 
 
 		 618 aa  243  7.999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  30.02 
 
 		 739 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  31.67 
 
 		 808 aa  241  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  29.87 
 
 		 709 aa  239  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  31.45 
 
 		 848 aa  239  1e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  30.18 
 
 		 859 aa  236  9e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  30.61 
 
 		 890 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  28.64 
 
 		 724 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  31.37 
 
 		 660 aa  234  4.0000000000000004e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  33.05 
 
 		 707 aa  232  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  31.47 
 
 		 876 aa  230  6e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  30.72 
 
 		 811 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  26.85 
 
 		 729 aa  228  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  28.18 
 
 		 717 aa  228  3e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  40.58 
 
 		 915 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  29.66 
 
 		 796 aa  224  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  34.21 
 
 		 847 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  29.3 
 
 		 795 aa  220  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  33.05 
 
 		 551 aa  220  7e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  27.33 
 
 		 676 aa  220  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  27.02 
 
 		 672 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  26.55 
 
 		 676 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  27.67 
 
 		 670 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  28.88 
 
 		 674 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  28.12 
 
 		 668 aa  210  7e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  27.3 
 
 		 672 aa  209  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  28.06 
 
 		 676 aa  205  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  31.49 
 
 		 676 aa  203  9e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.23 
 
 		 487 aa  201  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  26.51 
 
 		 788 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  25.9 
 
 		 710 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  30.08 
 
 		 467 aa  196  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  28.69 
 
 		 556 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  25.75 
 
 		 710 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  28.67 
 
 		 674 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  25.45 
 
 		 710 aa  195  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  34.07 
 
 		 873 aa  195  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  24.35 
 
 		 717 aa  194  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  25.45 
 
 		 710 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  27.93 
 
 		 674 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  35.36 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  27.41 
 
 		 674 aa  188  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  30.75 
 
 		 1064 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  29.95 
 
 		 1059 aa  162  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  26.92 
 
 		 724 aa  157  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  24.61 
 
 		 717 aa  153  8e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  25.65 
 
 		 710 aa  152  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  31.44 
 
 		 1412 aa  147  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 1342 aa  146  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  25.46 
 
 		 626 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  27.07 
 
 		 677 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  27.07 
 
 		 677 aa  145  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  24.3 
 
 		 607 aa  126  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0231  Mg chelatase, subunit ChlI  26.46 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  27.96 
 
 		 506 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0284  Mg chelatase, subunit ChlI  26.58 
 
 		 549 aa  57  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  23.48 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  25.7 
 
 		 506 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4074  Mg chelatase, subunit ChlI  26.94 
 
 		 514 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4016  putative ATP-dependent protease  26.44 
 
 		 506 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0359252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  25.7 
 
 		 516 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  29.14 
 
 		 509 aa  55.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  27.65 
 
 		 506 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  25.7 
 
 		 516 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  28.33 
 
 		 499 aa  55.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  25.3 
 
 		 506 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  25.7 
 
 		 506 aa  55.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4133  putative ATP-dependent protease  25.3 
 
 		 506 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.815544  normal  0.463834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  25.3 
 
 		 506 aa  55.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  36.54 
 
 		 507 aa  55.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3983  putative ATP-dependent protease  25.3 
 
 		 506 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>