94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_51597 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  100 
 
 
551 aa  1128    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  50.43 
 
 
848 aa  555  1e-157  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  49.49 
 
 
847 aa  541  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  49.48 
 
 
876 aa  522  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  49.38 
 
 
707 aa  501  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  40.15 
 
 
693 aa  351  2e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  37.25 
 
 
796 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  44.47 
 
 
688 aa  339  8e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  39.19 
 
 
686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  36.86 
 
 
717 aa  335  1e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  36.59 
 
 
882 aa  330  4e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  38.31 
 
 
808 aa  329  6e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  41.2 
 
 
890 aa  325  1e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  37.38 
 
 
932 aa  322  9.000000000000001e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  36.2 
 
 
729 aa  322  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  39.96 
 
 
989 aa  321  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  41.67 
 
 
679 aa  318  1e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  35.43 
 
 
755 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  37.48 
 
 
667 aa  317  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  36.86 
 
 
695 aa  317  4e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  36.7 
 
 
700 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  35.32 
 
 
706 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  45.84 
 
 
680 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  40.23 
 
 
859 aa  312  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  39.74 
 
 
739 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  46.09 
 
 
682 aa  311  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  37.02 
 
 
686 aa  311  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  40.93 
 
 
680 aa  311  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  35.44 
 
 
694 aa  311  2e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  34.55 
 
 
963 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  36.51 
 
 
724 aa  309  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  34.87 
 
 
700 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  35.78 
 
 
689 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  34.53 
 
 
703 aa  307  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  34.46 
 
 
700 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.58 
 
 
717 aa  306  6e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  31.92 
 
 
949 aa  303  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  35.28 
 
 
811 aa  301  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  38.04 
 
 
618 aa  300  4e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  36.42 
 
 
696 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  35.58 
 
 
795 aa  294  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  39.6 
 
 
709 aa  293  7e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  34.99 
 
 
788 aa  289  8e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  33.39 
 
 
841 aa  287  4e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  37.37 
 
 
791 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  36.66 
 
 
556 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  41.67 
 
 
660 aa  253  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  32.01 
 
 
761 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  40.62 
 
 
915 aa  245  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  32.57 
 
 
675 aa  212  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  34.9 
 
 
676 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  42.12 
 
 
873 aa  210  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  31.37 
 
 
676 aa  206  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  28.34 
 
 
676 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  34.44 
 
 
672 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  29.44 
 
 
710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  31.7 
 
 
487 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  35.11 
 
 
672 aa  200  5e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  32.14 
 
 
467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  28.23 
 
 
710 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  33.89 
 
 
670 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  34.52 
 
 
1059 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  28.06 
 
 
710 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  27.94 
 
 
710 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  30.17 
 
 
717 aa  193  9e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  35.1 
 
 
676 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  33.13 
 
 
1064 aa  189  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  34.94 
 
 
674 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  32.16 
 
 
717 aa  188  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  35.03 
 
 
674 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  34.94 
 
 
674 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  34.72 
 
 
668 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  29.66 
 
 
674 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  37.54 
 
 
458 aa  177  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  29.55 
 
 
724 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.57 
 
 
710 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 
1342 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  40.69 
 
 
1412 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.92 
 
 
626 aa  143  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  31.22 
 
 
677 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  31.22 
 
 
677 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  29.18 
 
 
607 aa  127  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0589  Mg chelatase, subunit ChlI  23.97 
 
 
506 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1175  Mg chelatase, subunit ChlI  22.11 
 
 
499 aa  46.6  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  25.73 
 
 
506 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  23.79 
 
 
506 aa  45.8  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  25.73 
 
 
507 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  26.84 
 
 
517 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  27.08 
 
 
508 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  33.33 
 
 
507 aa  45.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  25.17 
 
 
508 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  22.86 
 
 
513 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  23.38 
 
 
512 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  25.28 
 
 
503 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>