106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85790 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  60.57 
 
 		 890 aa  949    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  58.9 
 
 		 932 aa  905    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  100 
 
 		 859 aa  1773    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  53.29 
 
 		 796 aa  722    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  50.73 
 
 		 808 aa  681    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  39.61 
 
 		 693 aa  392  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  37.14 
 
 		 686 aa  383  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  37.77 
 
 		 688 aa  372  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  36.51 
 
 		 689 aa  355  2e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  36.43 
 
 		 700 aa  354  4e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  34.97 
 
 		 700 aa  349  1e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  32.27 
 
 		 755 aa  347  5e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  33.33 
 
 		 700 aa  334  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  36.82 
 
 		 680 aa  332  2e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  38.55 
 
 		 795 aa  331  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  36.42 
 
 		 682 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  35.58 
 
 		 680 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  34.55 
 
 		 717 aa  328  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  34.08 
 
 		 694 aa  327  6e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  37.45 
 
 		 679 aa  325  2e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  33.51 
 
 		 791 aa  325  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  33.63 
 
 		 724 aa  324  4e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  34.12 
 
 		 706 aa  323  6e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  33.7 
 
 		 686 aa  323  8e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  32.88 
 
 		 729 aa  320  6e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  31.16 
 
 		 949 aa  320  7e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  35.36 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  40.39 
 
 		 848 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  34.78 
 
 		 882 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  31.64 
 
 		 841 aa  318  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  36.48 
 
 		 811 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  36.28 
 
 		 788 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  35.75 
 
 		 717 aa  316  1.9999999999999998e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  34.13 
 
 		 989 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  33.57 
 
 		 696 aa  313  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  33.12 
 
 		 709 aa  311  4e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  36.35 
 
 		 847 aa  310  6.999999999999999e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  40.14 
 
 		 551 aa  308  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  33.69 
 
 		 876 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  32.66 
 
 		 963 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  32.28 
 
 		 695 aa  302  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  36.21 
 
 		 618 aa  300  6e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  36.59 
 
 		 707 aa  297  6e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  31.2 
 
 		 703 aa  294  4e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  30.35 
 
 		 667 aa  283  1e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  29.62 
 
 		 660 aa  261  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  34.16 
 
 		 556 aa  250  1e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  40.23 
 
 		 915 aa  244  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  30.7 
 
 		 675 aa  233  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  34.67 
 
 		 1059 aa  233  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  30.05 
 
 		 761 aa  231  6e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  35.26 
 
 		 1064 aa  211  3e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  34.59 
 
 		 1342 aa  208  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  28.2 
 
 		 487 aa  194  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.67 
 
 		 717 aa  193  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  35.89 
 
 		 873 aa  192  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  27.87 
 
 		 674 aa  190  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  28.07 
 
 		 674 aa  187  6e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  27.99 
 
 		 676 aa  187  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  27.3 
 
 		 670 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  34.64 
 
 		 467 aa  183  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  34.23 
 
 		 458 aa  181  4e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  28.1 
 
 		 674 aa  180  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  27.12 
 
 		 674 aa  179  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  26.85 
 
 		 676 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  27.14 
 
 		 676 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  26.59 
 
 		 672 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  25.33 
 
 		 717 aa  170  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  27.42 
 
 		 672 aa  169  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  26.85 
 
 		 710 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  27.21 
 
 		 668 aa  167  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  25.54 
 
 		 710 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  27.07 
 
 		 676 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  25.54 
 
 		 710 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  25.54 
 
 		 710 aa  161  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  24.59 
 
 		 710 aa  158  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.09 
 
 		 626 aa  157  8e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  24.88 
 
 		 724 aa  152  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  31.89 
 
 		 1412 aa  145  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  28.95 
 
 		 677 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  28.95 
 
 		 677 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  32.79 
 
 		 607 aa  107  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  23.5 
 
 		 314 aa  60.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0202  Mg chelatase-related protein  22.04 
 
 		 511 aa  50.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  27.27 
 
 		 507 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  27.27 
 
 		 507 aa  49.3  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  27.27 
 
 		 507 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4841  competence protein ComM  28.74 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  25.41 
 
 		 507 aa  46.6  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0584  Mg chelatase, subunit ChlI  26.53 
 
 		 509 aa  45.8  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1175  Mg chelatase, subunit ChlI  26.47 
 
 		 499 aa  45.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  27.6 
 
 		 507 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  24.56 
 
 		 506 aa  44.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_222  Holliday junction DNA helicase  25.68 
 
 		 312 aa  44.7  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0210  ATPase  27.03 
 
 		 307 aa  44.7  0.008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4223  Mg chelatase, subunit ChlI  25.57 
 
 		 508 aa  44.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  28.25 
 
 		 505 aa  44.3  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0097  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.2 
 
 		 466 aa  44.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2874  putative sigma54 specific transcriptional regulator  29.69 
 
 		 680 aa  44.3  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.681717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  28.07 
 
 		 526 aa  44.3  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>