116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1175 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  100 
 
 		 694 aa  1412    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  45.76 
 
 		 689 aa  610  1e-173  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  44.81 
 
 		 706 aa  589  1e-167  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  43.9 
 
 		 700 aa  582  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  45.11 
 
 		 700 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  44.87 
 
 		 700 aa  566  1e-160  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  44.13 
 
 		 717 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  43.76 
 
 		 703 aa  532  1e-150  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  43.6 
 
 		 696 aa  527  1e-148  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  42.05 
 
 		 688 aa  481  1e-134  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  40.78 
 
 		 686 aa  472  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  41.09 
 
 		 693 aa  475  1e-132  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  39.08 
 
 		 686 aa  433  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  39.97 
 
 		 680 aa  424  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  38.41 
 
 		 682 aa  422  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  37.99 
 
 		 680 aa  415  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  38.59 
 
 		 679 aa  414  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  34.73 
 
 		 695 aa  375  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  35.31 
 
 		 882 aa  363  7.0000000000000005e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  42.72 
 
 		 1342 aa  353  5.9999999999999994e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  45.93 
 
 		 1064 aa  345  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  34.53 
 
 		 791 aa  343  5e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  35.21 
 
 		 932 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  33.39 
 
 		 755 aa  339  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  43.81 
 
 		 1059 aa  336  9e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  33.23 
 
 		 890 aa  333  5e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  47.2 
 
 		 873 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  32.34 
 
 		 717 aa  329  9e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  37.45 
 
 		 811 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  34.29 
 
 		 667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  35.88 
 
 		 795 aa  324  3e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  31.13 
 
 		 989 aa  320  7e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  34.24 
 
 		 949 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  31.93 
 
 		 709 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  35.26 
 
 		 808 aa  318  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  33.44 
 
 		 859 aa  316  8e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  36.45 
 
 		 729 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  35.63 
 
 		 841 aa  313  6.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  34.53 
 
 		 676 aa  310  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  37.62 
 
 		 788 aa  309  9e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  37.04 
 
 		 618 aa  307  4.0000000000000004e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  33.58 
 
 		 739 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.75 
 
 		 551 aa  305  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  33.54 
 
 		 672 aa  303  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  31.39 
 
 		 848 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  32.95 
 
 		 674 aa  298  3e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  35.09 
 
 		 724 aa  296  6e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  32.21 
 
 		 672 aa  296  9e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  32.12 
 
 		 717 aa  295  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  32.78 
 
 		 676 aa  294  3e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  32.62 
 
 		 676 aa  294  4e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  33.82 
 
 		 707 aa  291  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  33.9 
 
 		 796 aa  290  6e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  32.08 
 
 		 710 aa  288  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  33.72 
 
 		 674 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  33.39 
 
 		 674 aa  286  9e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  33.17 
 
 		 674 aa  283  9e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  30.99 
 
 		 717 aa  282  1e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  32.32 
 
 		 670 aa  281  4e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  33.57 
 
 		 876 aa  280  7e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  31.4 
 
 		 710 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  33.45 
 
 		 847 aa  267  4e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  31.55 
 
 		 710 aa  267  4e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  31.86 
 
 		 710 aa  266  8e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  31.23 
 
 		 710 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  28.7 
 
 		 675 aa  263  8.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  30.44 
 
 		 668 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  30.47 
 
 		 676 aa  261  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  43.45 
 
 		 963 aa  258  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  43.39 
 
 		 458 aa  256  9e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  30.42 
 
 		 556 aa  252  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  43.3 
 
 		 660 aa  241  5e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  39.2 
 
 		 1412 aa  239  1e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  43.95 
 
 		 915 aa  239  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.44 
 
 		 487 aa  234  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  29.52 
 
 		 761 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  29.84 
 
 		 724 aa  213  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  30.71 
 
 		 467 aa  198  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  27.77 
 
 		 626 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  29.82 
 
 		 677 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  29.82 
 
 		 677 aa  189  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  29.91 
 
 		 607 aa  159  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  27.24 
 
 		 314 aa  104  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  25.62 
 
 		 507 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  22.43 
 
 		 501 aa  52  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  22.43 
 
 		 501 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  26.67 
 
 		 506 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  25.74 
 
 		 506 aa  51.2  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  25.17 
 
 		 323 aa  49.7  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  25.76 
 
 		 512 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  24.87 
 
 		 509 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  26.7 
 
 		 512 aa  47.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4192  Mg chelatase-related protein  25.27 
 
 		 529 aa  47.4  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  25.14 
 
 		 507 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  25.56 
 
 		 506 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  24.31 
 
 		 528 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3943  Mg chelatase, subunit ChlI  28.12 
 
 		 504 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3220  Mg chelatase, subunit D/I family protein  24.31 
 
 		 528 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  24.31 
 
 		 528 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  24.31 
 
 		 528 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>