109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_59868 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  61.94 
 
 		 724 aa  909    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  57.01 
 
 		 739 aa  834    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  100 
 
 		 729 aa  1504    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  47.82 
 
 		 667 aa  587  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  44.83 
 
 		 709 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  38.54 
 
 		 693 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  43.3 
 
 		 688 aa  392  1e-107  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  34.6 
 
 		 882 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  42.88 
 
 		 679 aa  370  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  36.64 
 
 		 686 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  35.44 
 
 		 755 aa  363  9e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  37.32 
 
 		 686 aa  362  1e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  40.91 
 
 		 680 aa  361  3e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  37.26 
 
 		 680 aa  359  9.999999999999999e-98  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  37.21 
 
 		 682 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  34.43 
 
 		 989 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  34.32 
 
 		 890 aa  349  1e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  35.38 
 
 		 706 aa  346  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  33.89 
 
 		 848 aa  342  1e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  34.22 
 
 		 847 aa  340  8e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  34.48 
 
 		 700 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  35.12 
 
 		 689 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  34.35 
 
 		 796 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  39.1 
 
 		 811 aa  336  7.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  36.19 
 
 		 717 aa  335  2e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  34.2 
 
 		 700 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  33.59 
 
 		 695 aa  334  3e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  32.52 
 
 		 791 aa  333  5e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  34.49 
 
 		 932 aa  330  7e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  35.29 
 
 		 700 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  35.88 
 
 		 703 aa  327  6e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  36.16 
 
 		 841 aa  325  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  36.89 
 
 		 788 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  36.45 
 
 		 694 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  32.28 
 
 		 808 aa  321  3e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  41.3 
 
 		 717 aa  320  9e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  36.64 
 
 		 551 aa  317  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  32.23 
 
 		 876 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  32.88 
 
 		 859 aa  315  1.9999999999999998e-84  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  33.49 
 
 		 963 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.93 
 
 		 696 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  33.55 
 
 		 707 aa  310  9e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  37.9 
 
 		 795 aa  309  1.0000000000000001e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  36.25 
 
 		 618 aa  303  8.000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  33.91 
 
 		 949 aa  298  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  35.05 
 
 		 556 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  44.97 
 
 		 660 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  36.45 
 
 		 915 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  28.46 
 
 		 761 aa  238  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  35.06 
 
 		 1059 aa  226  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  30.93 
 
 		 674 aa  223  8e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  31.66 
 
 		 674 aa  221  5e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  30.91 
 
 		 674 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  26.34 
 
 		 675 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  40.97 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  37.18 
 
 		 1064 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  28.25 
 
 		 717 aa  209  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  31.95 
 
 		 672 aa  207  8e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  30.43 
 
 		 674 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  39.21 
 
 		 873 aa  206  1e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  31.27 
 
 		 467 aa  206  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  30.94 
 
 		 676 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  31.13 
 
 		 676 aa  201  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  30.02 
 
 		 487 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  29.46 
 
 		 668 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  30.43 
 
 		 672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  28.82 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  29.84 
 
 		 676 aa  197  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  35.11 
 
 		 1342 aa  196  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  26.83 
 
 		 670 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  27.59 
 
 		 710 aa  190  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  27.59 
 
 		 710 aa  188  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  28.82 
 
 		 676 aa  187  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  27.12 
 
 		 710 aa  187  8e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  28.41 
 
 		 717 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  25.62 
 
 		 710 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  35.1 
 
 		 1412 aa  152  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.49 
 
 		 626 aa  151  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  26.67 
 
 		 677 aa  147  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  26.67 
 
 		 677 aa  147  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  26.64 
 
 		 724 aa  145  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  28.21 
 
 		 607 aa  124  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  23.23 
 
 		 507 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00409  ATPase  24.92 
 
 		 507 aa  50.8  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0221  Mg chelatase-related protein  22.77 
 
 		 501 aa  47  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  23.36 
 
 		 508 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0200  Mg chelatase-related protein  22.77 
 
 		 501 aa  46.2  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  21.07 
 
 		 501 aa  46.6  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  21.32 
 
 		 512 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  20.74 
 
 		 501 aa  45.8  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  28.07 
 
 		 506 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  23.39 
 
 		 507 aa  45.8  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  24.43 
 
 		 512 aa  45.8  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1529  Mg chelatase, subunit ChlI  28.99 
 
 		 506 aa  45.8  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00744934  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  29.37 
 
 		 508 aa  45.4  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  22.32 
 
 		 512 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0183  Mg chelatase-related protein  21.97 
 
 		 501 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  25.93 
 
 		 501 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  27.54 
 
 		 508 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  27.54 
 
 		 508 aa  45.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>