205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_981 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  100 
 
 
467 aa  964    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  37.45 
 
 
487 aa  268  1e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  36.02 
 
 
693 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  34 
 
 
686 aa  243  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  33.33 
 
 
688 aa  241  2e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  31.3 
 
 
739 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  33.87 
 
 
686 aa  216  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  31.64 
 
 
729 aa  215  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  30.12 
 
 
796 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  30.84 
 
 
963 aa  211  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  31.75 
 
 
882 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  31.03 
 
 
694 aa  211  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  29.57 
 
 
949 aa  211  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  32.4 
 
 
791 aa  209  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  33.47 
 
 
682 aa  207  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  32.86 
 
 
680 aa  207  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  33.14 
 
 
667 aa  206  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  33.53 
 
 
679 aa  206  6e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  29.58 
 
 
717 aa  206  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  31.26 
 
 
709 aa  206  1e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  32.93 
 
 
680 aa  203  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  29.75 
 
 
689 aa  204  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  28.88 
 
 
724 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  34.71 
 
 
717 aa  202  7e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  33.11 
 
 
551 aa  202  8e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  29.77 
 
 
989 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  31.89 
 
 
932 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  30.43 
 
 
808 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  30.89 
 
 
841 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  31.12 
 
 
700 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  31.92 
 
 
695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  31.06 
 
 
675 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  29.73 
 
 
706 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  29.51 
 
 
700 aa  196  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  32.75 
 
 
811 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  31.69 
 
 
915 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  32.72 
 
 
890 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  27.68 
 
 
703 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  31.23 
 
 
618 aa  189  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  32 
 
 
707 aa  187  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  32.83 
 
 
848 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  34.09 
 
 
795 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  34.83 
 
 
859 aa  186  9e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  34.16 
 
 
788 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  29.91 
 
 
700 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  29.18 
 
 
755 aa  180  5.999999999999999e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  28.21 
 
 
696 aa  177  5e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  33.5 
 
 
876 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  35.14 
 
 
847 aa  170  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  38.65 
 
 
660 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  34.05 
 
 
761 aa  156  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  31.59 
 
 
1064 aa  151  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  32.58 
 
 
1059 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  34.26 
 
 
873 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  35.48 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 
1342 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  26.14 
 
 
556 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  24.71 
 
 
676 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  24.36 
 
 
672 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  25.05 
 
 
674 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  24.56 
 
 
674 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  25.23 
 
 
710 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  23.97 
 
 
676 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  25.09 
 
 
710 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  26.87 
 
 
717 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  24.91 
 
 
710 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  25 
 
 
717 aa  114  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  24.36 
 
 
674 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  24.91 
 
 
710 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  29.49 
 
 
672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  30.34 
 
 
676 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  24.75 
 
 
670 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  23.56 
 
 
674 aa  109  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  28.87 
 
 
676 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  24.51 
 
 
668 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  30.4 
 
 
724 aa  100  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  24.12 
 
 
710 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  28.57 
 
 
626 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  31.53 
 
 
677 aa  90.1  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  31.53 
 
 
677 aa  90.1  8e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  23.75 
 
 
607 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  27.32 
 
 
1412 aa  74.3  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  30.46 
 
 
504 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  29.03 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  27.87 
 
 
506 aa  54.7  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  24.71 
 
 
507 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  23.81 
 
 
510 aa  53.5  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  25.73 
 
 
515 aa  53.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0237  Mg chelatase-related protein  25.86 
 
 
512 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  23.53 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  24.68 
 
 
485 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  28.07 
 
 
512 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.511309  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0161  Mg chelatase, subunit ChlI  28.07 
 
 
512 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2393  Mg chelatase, subunit ChlI  25.3 
 
 
503 aa  50.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  26.04 
 
 
506 aa  50.1  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  24.38 
 
 
513 aa  50.1  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3751  Mg chelatase, subunit ChlI  26.16 
 
 
506 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  26.34 
 
 
499 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  22.17 
 
 
512 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  23.9 
 
 
512 aa  49.7  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>