170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_18622 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  50.51 
 
 		 890 aa  701    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  53.71 
 
 		 932 aa  768    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  100 
 
 		 808 aa  1665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  50.59 
 
 		 859 aa  671    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  51.8 
 
 		 796 aa  751    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  40.33 
 
 		 693 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  37.39 
 
 		 688 aa  383  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  37.82 
 
 		 686 aa  382  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  33.38 
 
 		 755 aa  359  9.999999999999999e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  38.14 
 
 		 679 aa  356  8.999999999999999e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  36.92 
 
 		 680 aa  353  1e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  37.29 
 
 		 680 aa  351  4e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  37.15 
 
 		 686 aa  349  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  37.08 
 
 		 689 aa  346  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  35.82 
 
 		 700 aa  343  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  36.77 
 
 		 682 aa  342  2e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  34.36 
 
 		 706 aa  332  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  35.96 
 
 		 882 aa  332  2e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  32.23 
 
 		 700 aa  331  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  34.47 
 
 		 724 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  37.41 
 
 		 795 aa  329  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  34.98 
 
 		 700 aa  327  5e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  33.62 
 
 		 841 aa  327  6e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  38.54 
 
 		 788 aa  323  6e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  35.61 
 
 		 811 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  38.19 
 
 		 551 aa  322  1.9999999999999998e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  34.15 
 
 		 696 aa  318  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  35.26 
 
 		 694 aa  317  4e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  34.88 
 
 		 848 aa  317  5e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  33.48 
 
 		 739 aa  317  8e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  32.28 
 
 		 729 aa  316  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  37.13 
 
 		 791 aa  315  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  31.95 
 
 		 717 aa  315  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  37.41 
 
 		 618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  30.59 
 
 		 949 aa  310  5e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.83 
 
 		 717 aa  310  5e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  34.68 
 
 		 989 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  33.81 
 
 		 876 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  32.62 
 
 		 695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  34.9 
 
 		 847 aa  304  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  32.45 
 
 		 703 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  34.67 
 
 		 709 aa  298  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  35.1 
 
 		 707 aa  298  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  34.87 
 
 		 667 aa  290  7e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  30.64 
 
 		 963 aa  286  8e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  31.6 
 
 		 660 aa  268  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  40.22 
 
 		 915 aa  246  9e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  34.97 
 
 		 1059 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  32.75 
 
 		 761 aa  238  4e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  31.37 
 
 		 556 aa  237  7e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  31.63 
 
 		 675 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  35.5 
 
 		 1064 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  32.82 
 
 		 1342 aa  224  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  28.42 
 
 		 676 aa  200  7e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  28.01 
 
 		 672 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  27.84 
 
 		 676 aa  199  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  27.9 
 
 		 717 aa  196  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  29.92 
 
 		 487 aa  195  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  29.32 
 
 		 672 aa  190  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  30.24 
 
 		 467 aa  188  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  38.15 
 
 		 873 aa  187  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  36.71 
 
 		 458 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  25.92 
 
 		 717 aa  178  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  27.32 
 
 		 674 aa  177  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  27 
 
 		 670 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  26.35 
 
 		 710 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  26.58 
 
 		 676 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  28.14 
 
 		 674 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  28.25 
 
 		 674 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  26.3 
 
 		 710 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  26.2 
 
 		 710 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  26.2 
 
 		 710 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  26.66 
 
 		 674 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  31.2 
 
 		 724 aa  164  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  26.75 
 
 		 710 aa  162  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  26.75 
 
 		 668 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.31 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  26.47 
 
 		 676 aa  152  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 1412 aa  144  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  25.81 
 
 		 677 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  25.81 
 
 		 677 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  25.55 
 
 		 607 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0410  Mg chelatase, subunit ChlI  28.5 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  29.24 
 
 		 506 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4171  Mg chelatase, subunit ChlI  27.65 
 
 		 507 aa  55.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  25.79 
 
 		 314 aa  55.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  28.24 
 
 		 506 aa  54.7  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  26.44 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  26.44 
 
 		 507 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  24.23 
 
 		 507 aa  53.9  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  26.44 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3639  Mg chelatase, subunit ChlI  27.49 
 
 		 509 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0640  hypothetical protein  25.12 
 
 		 503 aa  52.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0624  hypothetical protein  25.59 
 
 		 503 aa  52.4  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  26.9 
 
 		 508 aa  51.6  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3288  magnesium chelatase family protein  26.36 
 
 		 508 aa  51.6  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0349  magnesium chelatase family protein  26.9 
 
 		 508 aa  51.6  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3624  Mg chelatase, subunit ChlI  26.9 
 
 		 508 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3820  Mg chelatase, subunit ChlI  26.9 
 
 		 508 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  25.52 
 
 		 506 aa  51.6  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>