117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF01550 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  58.45 
 
 
811 aa  899    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  100 
 
 
788 aa  1627    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  54.11 
 
 
795 aa  847    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  50.63 
 
 
717 aa  622  1e-177  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  48.87 
 
 
618 aa  547  1e-154  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  41.88 
 
 
693 aa  377  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  37.23 
 
 
688 aa  366  1e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  38.04 
 
 
882 aa  364  4e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  38.65 
 
 
989 aa  360  7e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  39.32 
 
 
755 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  37.85 
 
 
700 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  39.19 
 
 
791 aa  356  1e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  37.61 
 
 
963 aa  353  7e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  42.05 
 
 
679 aa  350  4e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  39.17 
 
 
739 aa  350  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  37.45 
 
 
689 aa  350  7e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  39.85 
 
 
796 aa  350  8e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  37.97 
 
 
724 aa  348  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  36.85 
 
 
949 aa  346  8e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  38.37 
 
 
680 aa  342  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  36.85 
 
 
841 aa  341  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  38.94 
 
 
932 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  37.84 
 
 
808 aa  336  7.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  34.16 
 
 
706 aa  336  9e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  40.7 
 
 
680 aa  336  1e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  39.88 
 
 
682 aa  332  1e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  34.25 
 
 
686 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  37.06 
 
 
890 aa  329  9e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  36.89 
 
 
729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  38.02 
 
 
695 aa  327  7e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  39.03 
 
 
667 aa  326  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  37.62 
 
 
694 aa  324  3e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  35.17 
 
 
703 aa  319  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  36.6 
 
 
700 aa  319  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  35.9 
 
 
859 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  35.07 
 
 
717 aa  317  5e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  34.45 
 
 
696 aa  316  9e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  35.77 
 
 
686 aa  311  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  36.26 
 
 
700 aa  311  4e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  37.64 
 
 
707 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  33.16 
 
 
848 aa  304  4.0000000000000003e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.73 
 
 
551 aa  300  7e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  33.82 
 
 
847 aa  294  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  35.36 
 
 
876 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  46.7 
 
 
660 aa  286  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  35.46 
 
 
709 aa  283  7.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  36.8 
 
 
915 aa  283  8.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  34.56 
 
 
556 aa  261  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  31.99 
 
 
761 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  30.57 
 
 
676 aa  230  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  37.35 
 
 
1064 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  31.91 
 
 
674 aa  218  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  37.07 
 
 
1059 aa  217  9e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  28.12 
 
 
676 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  29.38 
 
 
676 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  27.99 
 
 
672 aa  212  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  27.72 
 
 
670 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  29.38 
 
 
672 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  32.35 
 
 
674 aa  211  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  31.64 
 
 
674 aa  209  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  32.23 
 
 
674 aa  207  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  30.96 
 
 
487 aa  203  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  26.68 
 
 
717 aa  201  6e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  28.95 
 
 
668 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  28.76 
 
 
676 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  41.88 
 
 
873 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  26.83 
 
 
675 aa  193  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  35.41 
 
 
1342 aa  190  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28 
 
 
710 aa  190  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  37.72 
 
 
458 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  35.14 
 
 
467 aa  185  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  25.95 
 
 
710 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  27.39 
 
 
710 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  27.39 
 
 
710 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  27.39 
 
 
710 aa  182  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  28.49 
 
 
717 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  27.84 
 
 
677 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  27.84 
 
 
677 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  26.86 
 
 
626 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  26.68 
 
 
724 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.62 
 
 
607 aa  125  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  37.33 
 
 
1412 aa  124  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  26.27 
 
 
337 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  24.49 
 
 
512 aa  56.2  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  26.04 
 
 
513 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  25.57 
 
 
512 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_002936  DET0986  Mg chelatase-like protein  22.14 
 
 
507 aa  52  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0741814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  21.54 
 
 
501 aa  52  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  21.81 
 
 
501 aa  52  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  22.4 
 
 
507 aa  52  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  22.41 
 
 
323 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0877  Mg chelatase, subunit ChlI  21.41 
 
 
506 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.05 
 
 
619 aa  49.3  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  25.14 
 
 
512 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  25.57 
 
 
513 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  25.85 
 
 
513 aa  48.5  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  26.81 
 
 
508 aa  48.9  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  24.43 
 
 
513 aa  48.1  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2724  Mg chelatase, subunit ChlI  20.37 
 
 
512 aa  48.1  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.168012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  24.84 
 
 
508 aa  47.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>