93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1247 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  68.08 
 
 		 1064 aa  1511    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  100 
 
 		 1059 aa  2192    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  68.82 
 
 		 706 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  69.73 
 
 		 703 aa  558  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  65.25 
 
 		 717 aa  553  1e-156  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  55.96 
 
 		 689 aa  457  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  52.23 
 
 		 696 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  51.24 
 
 		 700 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  47.92 
 
 		 700 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  46.17 
 
 		 700 aa  369  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  46.84 
 
 		 1342 aa  364  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  43.81 
 
 		 694 aa  336  1e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  42.2 
 
 		 688 aa  300  9e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  40.66 
 
 		 693 aa  296  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  42.42 
 
 		 686 aa  293  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  51.96 
 
 		 1412 aa  289  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  41.1 
 
 		 686 aa  280  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  49.82 
 
 		 873 aa  270  1e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  37.86 
 
 		 680 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  36.84 
 
 		 932 aa  255  3e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  38.34 
 
 		 680 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  41.61 
 
 		 679 aa  254  9.000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  37.92 
 
 		 682 aa  252  3e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  35.88 
 
 		 796 aa  249  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  35.51 
 
 		 890 aa  243  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  34.97 
 
 		 808 aa  241  5.999999999999999e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  36.39 
 
 		 882 aa  237  9e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  36.92 
 
 		 695 aa  235  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  37.24 
 
 		 618 aa  229  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  35.69 
 
 		 841 aa  228  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  35.4 
 
 		 949 aa  224  6e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  33.58 
 
 		 717 aa  224  7e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  36.83 
 
 		 989 aa  222  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  38.01 
 
 		 811 aa  221  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  35.06 
 
 		 729 aa  219  2.9999999999999998e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  34.29 
 
 		 739 aa  218  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.71 
 
 		 717 aa  217  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  32.44 
 
 		 755 aa  216  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  36.25 
 
 		 791 aa  216  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  34.67 
 
 		 859 aa  215  3.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  36.26 
 
 		 667 aa  211  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  37.07 
 
 		 788 aa  205  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2478  protein splicing site  35.39 
 
 		 1080 aa  204  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  35.87 
 
 		 795 aa  203  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  36.39 
 
 		 724 aa  200  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  33.33 
 
 		 710 aa  196  2e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  34.38 
 
 		 709 aa  196  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  36.92 
 
 		 707 aa  195  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  31.04 
 
 		 710 aa  194  7e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  33.33 
 
 		 710 aa  194  8e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  37.23 
 
 		 847 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  33.08 
 
 		 710 aa  194  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  34.83 
 
 		 848 aa  193  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  34.23 
 
 		 551 aa  190  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  37.5 
 
 		 458 aa  189  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  30.57 
 
 		 717 aa  185  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  36.96 
 
 		 556 aa  183  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  36.33 
 
 		 670 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  35.42 
 
 		 876 aa  181  8e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  32.11 
 
 		 672 aa  180  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  31.88 
 
 		 676 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  31.62 
 
 		 672 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  32.12 
 
 		 676 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  35.96 
 
 		 674 aa  169  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  33.84 
 
 		 487 aa  167  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  35.52 
 
 		 676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  36.33 
 
 		 676 aa  163  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  34.83 
 
 		 668 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  55.88 
 
 		 963 aa  159  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2854  portal protein  30.24 
 
 		 1102 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279665  hitchhiker  0.00446406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  34.72 
 
 		 674 aa  159  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  35.89 
 
 		 674 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  35.89 
 
 		 674 aa  158  6e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  32.26 
 
 		 915 aa  155  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  35.4 
 
 		 724 aa  155  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  33.33 
 
 		 761 aa  149  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  29.4 
 
 		 675 aa  146  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  27.66 
 
 		 710 aa  137  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  41.29 
 
 		 660 aa  134  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  32.01 
 
 		 467 aa  132  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  26.95 
 
 		 677 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  26.95 
 
 		 677 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  25.74 
 
 		 626 aa  110  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.38 
 
 		 607 aa  93.6  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  29.2 
 
 		 314 aa  90.1  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2433  DNA polymerase B region  24.37 
 
 		 1773 aa  79  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.897381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2914  hypothetical protein  23.7 
 
 		 659 aa  58.2  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1721  hypothetical protein  20.94 
 
 		 2857 aa  57.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000300122 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2894  DNA polymerase B exonuclease  24.31 
 
 		 1345 aa  56.6  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  37.21 
 
 		 1272 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  26.67 
 
 		 1665 aa  53.9  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  23.19 
 
 		 1273 aa  52.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  31.96 
 
 		 903 aa  44.7  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>