92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01820 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  56.1 
 
 
556 aa  676    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  49.29 
 
 
882 aa  896    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  47.53 
 
 
755 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  100 
 
 
989 aa  2016    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  41.16 
 
 
791 aa  594  1e-168  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  38.15 
 
 
693 aa  393  1e-108  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  35.29 
 
 
689 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  37.33 
 
 
688 aa  373  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  35.21 
 
 
700 aa  368  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  35.46 
 
 
700 aa  365  2e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  37.22 
 
 
700 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  34.02 
 
 
729 aa  360  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  34.18 
 
 
686 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  35.25 
 
 
717 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  33.29 
 
 
739 aa  358  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  34.56 
 
 
706 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  38.65 
 
 
788 aa  354  4e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  36.89 
 
 
841 aa  352  2e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  39.15 
 
 
679 aa  351  4e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.96 
 
 
696 aa  350  6e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  36.23 
 
 
680 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  36.08 
 
 
682 aa  343  1e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  35.63 
 
 
680 aa  343  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  36.89 
 
 
811 aa  342  2e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  37.39 
 
 
795 aa  342  2e-92  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  37.06 
 
 
695 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  35.53 
 
 
963 aa  335  2e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  32.41 
 
 
686 aa  333  8e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  35.2 
 
 
949 aa  332  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  36.74 
 
 
796 aa  331  3e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  34.29 
 
 
932 aa  332  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  31.13 
 
 
694 aa  330  7e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.46 
 
 
717 aa  325  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  33.83 
 
 
667 aa  324  5e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  36.99 
 
 
618 aa  319  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  39.96 
 
 
551 aa  318  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  34.68 
 
 
808 aa  317  6e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  31.8 
 
 
890 aa  308  4.0000000000000004e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  34.8 
 
 
847 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  43.85 
 
 
724 aa  299  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  33.22 
 
 
707 aa  289  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  32.54 
 
 
709 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  37.07 
 
 
915 aa  285  3.0000000000000004e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  37.88 
 
 
703 aa  272  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  41.41 
 
 
859 aa  270  8.999999999999999e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  34.91 
 
 
848 aa  269  2e-70  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  46.08 
 
 
660 aa  261  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  31.39 
 
 
761 aa  254  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  30.38 
 
 
676 aa  248  4.9999999999999997e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  40.11 
 
 
876 aa  239  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  38.87 
 
 
873 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  37.37 
 
 
1059 aa  234  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  39.61 
 
 
458 aa  232  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  30.52 
 
 
672 aa  232  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  29.47 
 
 
676 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  31.24 
 
 
676 aa  227  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  29.73 
 
 
672 aa  226  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  36.39 
 
 
1064 aa  218  5e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  29.47 
 
 
717 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  35.27 
 
 
675 aa  213  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  29.13 
 
 
670 aa  209  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  28.86 
 
 
674 aa  207  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  30.12 
 
 
668 aa  207  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  29.95 
 
 
676 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  27.93 
 
 
674 aa  202  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  28.57 
 
 
674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  34.62 
 
 
1342 aa  198  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  28.55 
 
 
674 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  29.8 
 
 
487 aa  197  7e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  27.58 
 
 
717 aa  190  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  24.35 
 
 
710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  24.7 
 
 
710 aa  184  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  25.18 
 
 
710 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  27.69 
 
 
710 aa  180  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  32.1 
 
 
710 aa  179  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  28.61 
 
 
724 aa  172  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  36.97 
 
 
1412 aa  172  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  37.75 
 
 
467 aa  166  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  25.75 
 
 
626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  31.03 
 
 
677 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  31.03 
 
 
677 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.48 
 
 
607 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  29.71 
 
 
508 aa  49.7  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  27.23 
 
 
314 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  27.27 
 
 
506 aa  46.6  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0150  Mg chelatase, subunit ChlI  25 
 
 
501 aa  46.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  26.2 
 
 
470 aa  45.8  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  23.41 
 
 
509 aa  45.8  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  27.27 
 
 
485 aa  45.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  24.66 
 
 
507 aa  45.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  28.57 
 
 
508 aa  45.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  26.44 
 
 
508 aa  44.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>