44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5038 on replicon NC_013748
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  100 
 
 
314 aa  643    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  38.52 
 
 
700 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 
1342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  37.5 
 
 
700 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  35.68 
 
 
873 aa  139  6e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 
1412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  34.87 
 
 
717 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  32.78 
 
 
689 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  27.24 
 
 
694 aa  104  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  29.41 
 
 
1064 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  31.6 
 
 
700 aa  99.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  28.05 
 
 
703 aa  96.3  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  28.33 
 
 
696 aa  96.3  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  28.08 
 
 
717 aa  92.4  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  29.2 
 
 
1059 aa  90.1  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  29.84 
 
 
706 aa  90.5  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  31.08 
 
 
693 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  29.51 
 
 
688 aa  77.8  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  29.91 
 
 
710 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  28.93 
 
 
680 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  27.41 
 
 
682 aa  66.6  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  26.9 
 
 
680 aa  66.6  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  29.1 
 
 
932 aa  64.3  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  27.18 
 
 
679 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  28.57 
 
 
859 aa  60.1  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  25.91 
 
 
686 aa  60.1  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  26.77 
 
 
618 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  25.91 
 
 
686 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  26.62 
 
 
949 aa  56.6  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  30.77 
 
 
660 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  27.01 
 
 
796 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  25.79 
 
 
808 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  28.39 
 
 
890 aa  53.9  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  28.78 
 
 
695 aa  51.2  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  27.97 
 
 
963 aa  49.3  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  27.63 
 
 
761 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  29.56 
 
 
755 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  26.57 
 
 
675 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  23.56 
 
 
791 aa  47  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  27.62 
 
 
707 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  27.23 
 
 
989 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  25.56 
 
 
811 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  23.45 
 
 
841 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  23.35 
 
 
795 aa  42.4  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>