115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0830 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  47.16 
 
 
700 aa  670    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  61.78 
 
 
706 aa  900    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  48.44 
 
 
696 aa  653    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  49.79 
 
 
689 aa  685    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  100 
 
 
717 aa  1462    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  62.62 
 
 
703 aa  899    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  46 
 
 
700 aa  624  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  46.09 
 
 
700 aa  616  1e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  62.92 
 
 
1064 aa  567  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  65.25 
 
 
1059 aa  553  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  44.13 
 
 
694 aa  541  9.999999999999999e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  41.32 
 
 
688 aa  488  1e-136  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  40.66 
 
 
693 aa  465  1e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  42.33 
 
 
686 aa  457  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  37.97 
 
 
686 aa  422  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  39.79 
 
 
680 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  38.8 
 
 
680 aa  405  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  38.88 
 
 
682 aa  403  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  38.33 
 
 
679 aa  399  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  37.4 
 
 
695 aa  394  1e-108  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  51.21 
 
 
873 aa  364  2e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  36.01 
 
 
882 aa  358  9.999999999999999e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  35.08 
 
 
989 aa  350  5e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  44.5 
 
 
1342 aa  348  3e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  33.82 
 
 
755 aa  347  6e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  34.31 
 
 
791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  31.97 
 
 
717 aa  337  7e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  49.5 
 
 
458 aa  335  1e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  34.88 
 
 
841 aa  333  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  36.19 
 
 
729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  36.67 
 
 
551 aa  329  1.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  35.14 
 
 
890 aa  328  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  36.65 
 
 
932 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  35.39 
 
 
963 aa  326  8.000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  34.51 
 
 
796 aa  323  5e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  35.97 
 
 
848 aa  323  6e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  35.16 
 
 
739 aa  320  7.999999999999999e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  36.57 
 
 
724 aa  319  9e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  34.55 
 
 
859 aa  316  9.999999999999999e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  34.82 
 
 
717 aa  316  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  35.59 
 
 
667 aa  315  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  31.95 
 
 
808 aa  314  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  34.44 
 
 
811 aa  312  1e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  33.39 
 
 
707 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  35.46 
 
 
618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  32.23 
 
 
676 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  35.07 
 
 
788 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  32.89 
 
 
672 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  34.42 
 
 
795 aa  303  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  32.38 
 
 
717 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  32.73 
 
 
676 aa  302  1e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  31.86 
 
 
675 aa  301  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  33.46 
 
 
709 aa  299  1e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  31.37 
 
 
710 aa  299  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  33.66 
 
 
672 aa  299  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  32.78 
 
 
676 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  31.23 
 
 
710 aa  296  7e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  34.11 
 
 
847 aa  294  4e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  30 
 
 
710 aa  294  4e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  29.96 
 
 
710 aa  293  7e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  33.48 
 
 
674 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  34.47 
 
 
674 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  34.47 
 
 
876 aa  288  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  34.3 
 
 
674 aa  286  7e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  49.51 
 
 
1412 aa  284  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  35.18 
 
 
761 aa  283  8.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  31.86 
 
 
670 aa  282  1e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  32.79 
 
 
674 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  32.46 
 
 
668 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  41.99 
 
 
949 aa  266  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  32.02 
 
 
676 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  32.54 
 
 
556 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  30.97 
 
 
724 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  41.99 
 
 
915 aa  250  8e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  27.78 
 
 
710 aa  245  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  39.66 
 
 
660 aa  240  8e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.51 
 
 
487 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  29.79 
 
 
626 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  28.95 
 
 
467 aa  193  9e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  28.38 
 
 
677 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  28.38 
 
 
677 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  28.61 
 
 
607 aa  148  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  28.08 
 
 
314 aa  92.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  28.32 
 
 
506 aa  51.2  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  26.9 
 
 
506 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1022  Mg chelatase-related protein  27.86 
 
 
509 aa  49.3  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  unclonable  0.00000000780236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  25.71 
 
 
508 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  25.87 
 
 
509 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0409  Mg chelatase, subunit ChlI  25.55 
 
 
501 aa  47.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00467641  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0424  Mg chelatase, subunit ChlI  25.55 
 
 
501 aa  48.1  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.55 
 
 
334 aa  47.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0648  Mg chelatase-like protein  27.54 
 
 
528 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0405  Mg chelatase-related protein  27.54 
 
 
526 aa  47  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  27.88 
 
 
337 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0195  Mg chelatase, subunit D/I family protein  27.54 
 
 
528 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1398  Mg chelatase, subunit D/I family protein  27.54 
 
 
528 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0466  putative Mg chelatase  27.54 
 
 
528 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.587409  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0485  putative Mg chelatase  27.54 
 
 
528 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428231  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2825  Mg chelatase, subunit D/I family protein  27.54 
 
 
528 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2221  putative magnesium chelatase  28.29 
 
 
336 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>