145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_468 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  54.71 
 
 
963 aa  707    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  50.6 
 
 
949 aa  659    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  52.58 
 
 
841 aa  655    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  100 
 
 
660 aa  1366    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  47.07 
 
 
915 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  36.89 
 
 
717 aa  349  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  38.38 
 
 
618 aa  339  9.999999999999999e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  36.86 
 
 
882 aa  330  6e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  34.28 
 
 
755 aa  323  9.000000000000001e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  37.89 
 
 
788 aa  316  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  31.98 
 
 
739 aa  307  3e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  35.9 
 
 
989 aa  306  7e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  31.78 
 
 
848 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  48 
 
 
724 aa  300  7e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  45.35 
 
 
693 aa  299  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  45.17 
 
 
811 aa  295  2e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  45.98 
 
 
688 aa  295  2e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  46.71 
 
 
729 aa  292  1e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  32.28 
 
 
707 aa  291  4e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  43.61 
 
 
667 aa  286  9e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  31.55 
 
 
808 aa  278  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  46.04 
 
 
795 aa  278  3e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  45.45 
 
 
709 aa  277  5e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  43.88 
 
 
791 aa  274  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  39.78 
 
 
686 aa  269  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  32.96 
 
 
761 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  38.72 
 
 
700 aa  267  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  32.08 
 
 
847 aa  266  8e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  42.69 
 
 
695 aa  265  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  45.71 
 
 
679 aa  264  4e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  43.23 
 
 
686 aa  264  4e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  41.67 
 
 
551 aa  264  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  41.55 
 
 
796 aa  263  8.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  44.88 
 
 
682 aa  262  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  42.99 
 
 
700 aa  263  1e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  45.15 
 
 
680 aa  262  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  44.62 
 
 
932 aa  259  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  44.88 
 
 
680 aa  259  1e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  38.08 
 
 
689 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  36.39 
 
 
706 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  43.3 
 
 
694 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  39.17 
 
 
717 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  36.93 
 
 
700 aa  251  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  41.01 
 
 
876 aa  248  3e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  36.91 
 
 
890 aa  243  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  37.33 
 
 
703 aa  243  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  37.6 
 
 
859 aa  240  5e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  30.7 
 
 
675 aa  230  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  31.68 
 
 
556 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  36.26 
 
 
696 aa  212  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  36.39 
 
 
873 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  34.4 
 
 
676 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  34.4 
 
 
668 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  37.17 
 
 
487 aa  189  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  33.06 
 
 
670 aa  187  5e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  33.24 
 
 
674 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  32.7 
 
 
674 aa  172  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  32.7 
 
 
674 aa  172  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  35.02 
 
 
458 aa  169  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  38.65 
 
 
467 aa  167  5e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  30.85 
 
 
676 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  30.38 
 
 
676 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  32.65 
 
 
672 aa  164  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  32.63 
 
 
676 aa  163  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  30.83 
 
 
672 aa  162  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  31.65 
 
 
717 aa  160  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  29.95 
 
 
710 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  29.95 
 
 
710 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  31.97 
 
 
674 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  29.95 
 
 
710 aa  154  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  40.87 
 
 
1064 aa  153  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  29.3 
 
 
710 aa  153  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  30.08 
 
 
626 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  28.43 
 
 
724 aa  145  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  41.29 
 
 
1059 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  28.35 
 
 
717 aa  144  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  44.37 
 
 
1342 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  34.8 
 
 
1412 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  30.65 
 
 
677 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  30.65 
 
 
677 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  28.37 
 
 
710 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  34.7 
 
 
607 aa  108  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0331  competence-related protein  23.58 
 
 
509 aa  57.8  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  30.77 
 
 
314 aa  55.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0183  Mg chelatase-related protein  22.32 
 
 
501 aa  54.3  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  21.81 
 
 
507 aa  54.3  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  21.81 
 
 
507 aa  54.3  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  21.81 
 
 
507 aa  54.3  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0200  Mg chelatase-related protein  22.32 
 
 
501 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4153  putative ATP-dependent protease  25.86 
 
 
506 aa  52.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0221  Mg chelatase-related protein  22.32 
 
 
501 aa  53.1  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03644  predicted bifunctional enzyme and transcriptional regulator  25.86 
 
 
516 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4209  Mg chelatase, subunit ChlI  25.86 
 
 
506 aa  52  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03593  hypothetical protein  25.86 
 
 
516 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.11947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4290  putative ATP-dependent protease  27.11 
 
 
506 aa  51.6  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5201  putative ATP-dependent protease  25.48 
 
 
506 aa  52  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  27.86 
 
 
507 aa  52  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  27.73 
 
 
508 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  22.33 
 
 
508 aa  51.6  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4278  putative ATP-dependent protease  26.97 
 
 
506 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>